Protein–RNA interactions for Protein: Q06543

GPN3, GPN-loop GTPase 3, yeastyeast

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GPN3Q06543 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.82□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.82□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 DDR2YOL052C-A 186 nt9.82□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.81□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 YEL076CYEL076C 651 nt9.81□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 YLR464WYLR464W 651 nt9.81□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 GAL1YBR020W 1587 nt9.8□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 TRM5YHR070W 1500 nt9.8□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 AAC1YMR056C 930 nt9.79□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 LPX1YOR084W 1164 nt9.79□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.78□□□□□ -0.84
GPN3Q06543 DPS1YLL018C 1674 nt9.77□□□□□ -0.85
GPN3Q06543 DIC1YLR348C 897 nt9.76□□□□□ -0.85
GPN3Q06543 BNA2YJR078W 1362 nt9.75□□□□□ -0.85
GPN3Q06543 BMT6YLR063W 1098 nt9.74□□□□□ -0.85
GPN3Q06543 AQY1YPR192W 918 nt9.73□□□□□ -0.85
GPN3Q06543 ANP1YEL036C 1503 nt9.72□□□□□ -0.85
GPN3Q06543 WSC2YNL283C 1512 nt9.7□□□□□ -0.86
GPN3Q06543 MIC12YBR262C 321 nt9.69□□□□□ -0.86
GPN3Q06543 YKR005CYKR005C 1578 nt9.68□□□□□ -0.86
GPN3Q06543 YCL074WYCL074W 927 nt9.65□□□□□ -0.86
GPN3Q06543 STB1YNL309W 1263 nt9.65□□□□□ -0.86
GPN3Q06543 SPC25YER018C 666 nt9.64□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 NAR1YNL240C 1476 nt9.64□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.63□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 DUS1YML080W 1272 nt9.63□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 FEN2YCR028C 1539 nt9.62□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 HHO1YPL127C 777 nt9.62□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 AGP1YCL025C 1902 nt9.61□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 YGR259CYGR259C 441 nt9.6□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 GPI16YHR188C 1833 nt9.6□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 IRC24YIR036C 792 nt9.59□□□□□ -0.87
GPN3Q06543 BIO5YNR056C 1686 nt9.58□□□□□ -0.88
GPN3Q06543 SNF1YDR477W 1902 nt9.57□□□□□ -0.88
GPN3Q06543 YIR016WYIR016W 798 nt9.57□□□□□ -0.88
GPN3Q06543 YLR235CYLR235C 399 nt9.57□□□□□ -0.88
GPN3Q06543 TIM23YNR017W 669 nt9.56□□□□□ -0.88
GPN3Q06543 YLR179CYLR179C 606 nt9.55□□□□□ -0.88
GPN3Q06543 HSL7YBR133C 2484 nt9.54□□□□□ -0.88
GPN3Q06543 YGR201CYGR201C 678 nt9.53□□□□□ -0.88
GPN3Q06543 PTH1YHR189W 573 nt9.52□□□□□ -0.89
GPN3Q06543 CCT4YDL143W 1587 nt9.51□□□□□ -0.89
GPN3Q06543 VPS60YDR486C 690 nt9.51□□□□□ -0.89
GPN3Q06543 PBP1YGR178C 2169 nt9.5□□□□□ -0.89
GPN3Q06543 CYT2YKL087C 675 nt9.5□□□□□ -0.89
GPN3Q06543 AHT1YHR093W 549 nt9.47□□□□□ -0.89
GPN3Q06543 XDJ1YLR090W 1380 nt9.47□□□□□ -0.89
GPN3Q06543 STR3YGL184C 1398 nt9.46□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 SWC5YBR231C 912 nt9.45□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 ALG3YBL082C 1377 nt9.44□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.43□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.43□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.43□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.43□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 YPR064WYPR064W 420 nt9.41□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 FRE6YLL051C 2139 nt9.41□□□□□ -0.9
GPN3Q06543 YKL030WYKL030W 606 nt9.39□□□□□ -0.91
GPN3Q06543 GOR1YNL274C 1053 nt9.39□□□□□ -0.91
GPN3Q06543 SPP1YPL138C 1062 nt9.38□□□□□ -0.91
GPN3Q06543 DUT1YBR252W 444 nt9.38□□□□□ -0.91
GPN3Q06543 AVT6YER119C 1347 nt9.35□□□□□ -0.91
GPN3Q06543 AQY2YLL052C 450 nt9.35□□□□□ -0.91
GPN3Q06543 RTN2YDL204W 1182 nt9.34□□□□□ -0.91
GPN3Q06543 GDH3YAL062W 1374 nt9.34□□□□□ -0.91
GPN3Q06543 TAD3YLR316C 969 nt9.32□□□□□ -0.92
GPN3Q06543 CMP2YML057W 1815 nt9.31□□□□□ -0.92
GPN3Q06543 HEL2YDR266C 1920 nt9.29□□□□□ -0.92
GPN3Q06543 YLR415CYLR415C 339 nt9.21□□□□□ -0.94
GPN3Q06543 SHM2YLR058C 1410 nt9.21□□□□□ -0.94
GPN3Q06543 NDI1YML120C 1542 nt9.21□□□□□ -0.94
GPN3Q06543 BDH1YAL060W 1149 nt9.2□□□□□ -0.94
GPN3Q06543 YAT1YAR035W 2064 nt9.19□□□□□ -0.94
GPN3Q06543 TIM17YJL143W 477 nt9.18□□□□□ -0.94
GPN3Q06543 DAT1YML113W 747 nt9.18□□□□□ -0.94
GPN3Q06543 ARP6YLR085C 1317 nt9.14□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 PLB1YMR008C 1995 nt9.14□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 YCR102CYCR102C 1107 nt9.13□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 NBP35YGL091C 987 nt9.13□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 SFP1YLR403W 2052 nt9.12□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 ALD4YOR374W 1560 nt9.12□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 HIF1YLL022C 1158 nt9.11□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 SPT20YOL148C 1815 nt9.1□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.1□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 NIT1YIL164C 600 nt9.1□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 INA1YLR413W 2028 nt9.09□□□□□ -0.95
GPN3Q06543 YSP3YOR003W 1437 nt9.07□□□□□ -0.96
GPN3Q06543 PRM5YIL117C 957 nt9.06□□□□□ -0.96
GPN3Q06543 MET2YNL277W 1461 nt9.05□□□□□ -0.96
GPN3Q06543 NPP1YCR026C 2229 nt9.05□□□□□ -0.96
GPN3Q06543 RTG1YOL067C 534 nt9.03□□□□□ -0.96
GPN3Q06543 SGT2YOR007C 1041 nt9.03□□□□□ -0.96
GPN3Q06543 SSN3YPL042C 1668 nt9.03□□□□□ -0.96
GPN3Q06543 RPC82YPR190C 1965 nt9.01□□□□□ -0.97
GPN3Q06543 LSC2YGR244C 1284 nt8.99□□□□□ -0.97
GPN3Q06543 SAM35YHR083W 990 nt8.98□□□□□ -0.97
GPN3Q06543 ZRT3YKL175W 1512 nt8.98□□□□□ -0.97
GPN3Q06543 UTR1YJR049C 1593 nt8.98□□□□□ -0.97
GPN3Q06543 BSP1YPR171W 1731 nt8.97□□□□□ -0.97
GPN3Q06543 GAP1YKR039W 1809 nt8.95□□□□□ -0.98
GPN3Q06543 HUA1YGR268C 597 nt8.94□□□□□ -0.98
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