Protein–RNA interactions for Protein: Q06538

CSC1, Calcium permeable stress-gated cation channel 1, yeastyeast

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSC1Q06538 YLR179CYLR179C 606 nt12.6□□□□□ -0.39
CSC1Q06538 YLL053CYLL053C 459 nt12.59□□□□□ -0.39
CSC1Q06538 PTK1YKL198C 1989 nt12.59□□□□□ -0.39
CSC1Q06538 PAU16YKL224C 372 nt12.57□□□□□ -0.4
CSC1Q06538 YFR018CYFR018C 1092 nt12.56□□□□□ -0.4
CSC1Q06538 YDR509WYDR509W 348 nt12.55□□□□□ -0.4
CSC1Q06538 ARA2YMR041C 1008 nt12.55□□□□□ -0.4
CSC1Q06538 YPR064WYPR064W 420 nt12.55□□□□□ -0.4
CSC1Q06538 MET8YBR213W 825 nt12.54□□□□□ -0.4
CSC1Q06538 RRT5YFR032C 870 nt12.52□□□□□ -0.41
CSC1Q06538 LYS4YDR234W 2082 nt12.51□□□□□ -0.41
CSC1Q06538 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.5□□□□□ -0.41
CSC1Q06538 FTR1YER145C 1215 nt12.5□□□□□ -0.41
CSC1Q06538 ERF2YLR246W 1080 nt12.49□□□□□ -0.41
CSC1Q06538 PRE6YOL038W 765 nt12.49□□□□□ -0.41
CSC1Q06538 TAD3YLR316C 969 nt12.47□□□□□ -0.41
CSC1Q06538 CRR1YLR213C 1269 nt12.46□□□□□ -0.41
CSC1Q06538 WSC2YNL283C 1512 nt12.46□□□□□ -0.42
CSC1Q06538 GAL1YBR020W 1587 nt12.45□□□□□ -0.42
CSC1Q06538 ATF2YGR177C 1608 nt12.44□□□□□ -0.42
CSC1Q06538 AHT1YHR093W 549 nt12.44□□□□□ -0.42
CSC1Q06538 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.44□□□□□ -0.42
CSC1Q06538 SRN2YLR119W 642 nt12.43□□□□□ -0.42
CSC1Q06538 TRM5YHR070W 1500 nt12.42□□□□□ -0.42
CSC1Q06538 AQY1YPR192W 918 nt12.4□□□□□ -0.42
CSC1Q06538 SBA1YKL117W 651 nt12.39□□□□□ -0.43
CSC1Q06538 YFL067WYFL067W 528 nt12.38□□□□□ -0.43
CSC1Q06538 CLB6YGR109C 1143 nt12.38□□□□□ -0.43
CSC1Q06538 YLR122CYLR122C 378 nt12.38□□□□□ -0.43
CSC1Q06538 DDR2YOL052C-A 186 nt12.34□□□□□ -0.43
CSC1Q06538 YFL066CYFL066C 1179 nt12.33□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 Q0144Q0144 330 nt12.33□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 YFL054CYFL054C 1941 nt12.33□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 ABZ2YMR289W 1125 nt12.32□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 SNG1YGR197C 1644 nt12.31□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 HEM12YDR047W 1089 nt12.31□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 SPC25YER018C 666 nt12.31□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 MIC10YCL057C-A 294 nt12.31□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.3□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 STB1YNL309W 1263 nt12.3□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 YJL225CYJL225C 5277 nt12.3□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 PEX25YPL112C 1185 nt12.29□□□□□ -0.44
CSC1Q06538 SEM1YDR363W-A 270 nt12.27□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 ANP1YEL036C 1503 nt12.27□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.26□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 BDH1YAL060W 1149 nt12.25□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 VAR1Q0140 1197 nt12.24□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 SPT8YLR055C 1809 nt12.23□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 YSP3YOR003W 1437 nt12.23□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 YNL115CYNL115C 1935 nt12.22□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.22□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 GPI16YHR188C 1833 nt12.22□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 CCT4YDL143W 1587 nt12.22□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 YLR415CYLR415C 339 nt12.21□□□□□ -0.45
CSC1Q06538 NAT4YMR069W 858 nt12.2□□□□□ -0.46
CSC1Q06538 FEN2YCR028C 1539 nt12.2□□□□□ -0.46
CSC1Q06538 VPS60YDR486C 690 nt12.18□□□□□ -0.46
CSC1Q06538 GLK1YCL040W 1503 nt12.14□□□□□ -0.47
CSC1Q06538 ALG3YBL082C 1377 nt12.14□□□□□ -0.47
CSC1Q06538 ARP10YDR106W 855 nt12.12□□□□□ -0.47
CSC1Q06538 SWC5YBR231C 912 nt12.12□□□□□ -0.47
CSC1Q06538 RAX1YOR301W 1308 nt12.11□□□□□ -0.47
CSC1Q06538 PAC11YDR488C 1602 nt12.09□□□□□ -0.47
CSC1Q06538 YIR016WYIR016W 798 nt12.09□□□□□ -0.47
CSC1Q06538 SWE1YJL187C 2460 nt12.09□□□□□ -0.47
CSC1Q06538 TOM20YGR082W 552 nt12.07□□□□□ -0.48
CSC1Q06538 MIC12YBR262C 321 nt12.06□□□□□ -0.48
CSC1Q06538 MSF1YPR047W 1410 nt12.05□□□□□ -0.48
CSC1Q06538 THI74YDR438W 1113 nt12.03□□□□□ -0.48
CSC1Q06538 MIR1YJR077C 936 nt12.03□□□□□ -0.48
CSC1Q06538 VPS75YNL246W 795 nt12.03□□□□□ -0.48
CSC1Q06538 LCP5YER127W 1074 nt12.02□□□□□ -0.49
CSC1Q06538 BNA2YJR078W 1362 nt12.02□□□□□ -0.49
CSC1Q06538 CCA1YER168C 1641 nt11.96□□□□□ -0.5
CSC1Q06538 URH1YDR400W 1023 nt11.94□□□□□ -0.5
CSC1Q06538 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.94□□□□□ -0.5
CSC1Q06538 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.94□□□□□ -0.5
CSC1Q06538 PAU7YAR020C 168 nt11.9□□□□□ -0.5
CSC1Q06538 HHO1YPL127C 777 nt11.9□□□□□ -0.5
CSC1Q06538 UTP6YDR449C 1323 nt11.89□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 DAT1YML113W 747 nt11.89□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 XDJ1YLR090W 1380 nt11.88□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.87□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 YGR201CYGR201C 678 nt11.87□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 TIM17YJL143W 477 nt11.87□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 AGP1YCL025C 1902 nt11.86□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 PET20YPL159C 762 nt11.85□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 YMR244WYMR244W 1068 nt11.84□□□□□ -0.51
CSC1Q06538 SHM2YLR058C 1410 nt11.82□□□□□ -0.52
CSC1Q06538 UBA4YHR111W 1323 nt11.81□□□□□ -0.52
CSC1Q06538 GDH3YAL062W 1374 nt11.8□□□□□ -0.52
CSC1Q06538 YGL034CYGL034C 366 nt11.8□□□□□ -0.52
CSC1Q06538 YCR099CYCR099C 468 nt11.79□□□□□ -0.52
CSC1Q06538 GLR1YPL091W 1452 nt11.77□□□□□ -0.52
CSC1Q06538 SHB17YKR043C 816 nt11.77□□□□□ -0.53
CSC1Q06538 YSR3YKR053C 1215 nt11.75□□□□□ -0.53
CSC1Q06538 HMT1YBR034C 1047 nt11.75□□□□□ -0.53
CSC1Q06538 NIT1YIL164C 600 nt11.74□□□□□ -0.53
CSC1Q06538 YJL118WYJL118W 660 nt11.74□□□□□ -0.53
CSC1Q06538 DUT1YBR252W 444 nt11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms