Protein–RNA interactions for Protein: Q05931

SSQ1, Heat shock protein SSQ1, mitochondrial, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1Q05931 GAL1YBR020W 1587 nt10.51□□□□□ -0.73
SSQ1Q05931 TRM5YHR070W 1500 nt10.5□□□□□ -0.73
SSQ1Q05931 SPP1YPL138C 1062 nt10.5□□□□□ -0.73
SSQ1Q05931 AQY1YPR192W 918 nt10.48□□□□□ -0.73
SSQ1Q05931 FUR4YBR021W 1902 nt10.46□□□□□ -0.73
SSQ1Q05931 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.46□□□□□ -0.73
SSQ1Q05931 TIM23YNR017W 669 nt10.46□□□□□ -0.73
SSQ1Q05931 SNG1YGR197C 1644 nt10.45□□□□□ -0.74
SSQ1Q05931 RAX1YOR301W 1308 nt10.45□□□□□ -0.74
SSQ1Q05931 MIC10YCL057C-A 294 nt10.45□□□□□ -0.74
SSQ1Q05931 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.44□□□□□ -0.74
SSQ1Q05931 YLR179CYLR179C 606 nt10.44□□□□□ -0.74
SSQ1Q05931 YKL030WYKL030W 606 nt10.41□□□□□ -0.74
SSQ1Q05931 BNA2YJR078W 1362 nt10.4□□□□□ -0.74
SSQ1Q05931 PRP4YPR178W 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 STB1YNL309W 1263 nt10.38□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.37□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 AAC1YMR056C 930 nt10.37□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 ANP1YEL036C 1503 nt10.35□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.35□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 YEL076CYEL076C 651 nt10.35□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 YLR464WYLR464W 651 nt10.35□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 CCA1YER168C 1641 nt10.35□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 GPI16YHR188C 1833 nt10.35□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 SPC25YER018C 666 nt10.34□□□□□ -0.75
SSQ1Q05931 YPR064WYPR064W 420 nt10.33□□□□□ -0.76
SSQ1Q05931 FEN2YCR028C 1539 nt10.32□□□□□ -0.76
SSQ1Q05931 DPS1YLL018C 1674 nt10.31□□□□□ -0.76
SSQ1Q05931 BMT6YLR063W 1098 nt10.31□□□□□ -0.76
SSQ1Q05931 AHT1YHR093W 549 nt10.28□□□□□ -0.76
SSQ1Q05931 CCT4YDL143W 1587 nt10.27□□□□□ -0.76
SSQ1Q05931 SWC5YBR231C 912 nt10.27□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 HSL7YBR133C 2484 nt10.26□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 NAR1YNL240C 1476 nt10.26□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 VPS60YDR486C 690 nt10.24□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 WSC2YNL283C 1512 nt10.23□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 YIR016WYIR016W 798 nt10.23□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 HHO1YPL127C 777 nt10.23□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 TAD3YLR316C 969 nt10.22□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 MIC12YBR262C 321 nt10.21□□□□□ -0.77
SSQ1Q05931 YKR005CYKR005C 1578 nt10.21□□□□□ -0.78
SSQ1Q05931 DUS1YML080W 1272 nt10.17□□□□□ -0.78
SSQ1Q05931 RTG1YOL067C 534 nt10.17□□□□□ -0.78
SSQ1Q05931 SSN3YPL042C 1668 nt10.15□□□□□ -0.78
SSQ1Q05931 HUA1YGR268C 597 nt10.15□□□□□ -0.78
SSQ1Q05931 ALG3YBL082C 1377 nt10.14□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 HEL2YDR266C 1920 nt10.14□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 BIO5YNR056C 1686 nt10.12□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 YCL074WYCL074W 927 nt10.12□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 YGR201CYGR201C 678 nt10.12□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 YGR259CYGR259C 441 nt10.12□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.12□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.12□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.1□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 YLR415CYLR415C 339 nt10.09□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 SNF1YDR477W 1902 nt10.09□□□□□ -0.79
SSQ1Q05931 IRC24YIR036C 792 nt10.08□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 CMP2YML057W 1815 nt10.07□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 MET2YNL277W 1461 nt10.06□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 AGP1YCL025C 1902 nt10.06□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 ADO1YJR105W 1023 nt10.06□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 GID7YCL039W 2238 nt10.06□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 SFP1YLR403W 2052 nt10.05□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 MRPL8YJL063C 717 nt10.05□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 GOR1YNL274C 1053 nt10.05□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 XDJ1YLR090W 1380 nt10.04□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 YAT1YAR035W 2064 nt10.04□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 CYT2YKL087C 675 nt10.04□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 GDH3YAL062W 1374 nt10.03□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 AVT6YER119C 1347 nt10.03□□□□□ -0.8
SSQ1Q05931 NPP1YCR026C 2229 nt10.02□□□□□ -0.81
SSQ1Q05931 BDH1YAL060W 1149 nt10.02□□□□□ -0.81
SSQ1Q05931 PBP1YGR178C 2169 nt10.01□□□□□ -0.81
SSQ1Q05931 TIM17YJL143W 477 nt9.98□□□□□ -0.81
SSQ1Q05931 SHM2YLR058C 1410 nt9.93□□□□□ -0.82
SSQ1Q05931 AQY2YLL052C 450 nt9.93□□□□□ -0.82
SSQ1Q05931 STR3YGL184C 1398 nt9.92□□□□□ -0.82
SSQ1Q05931 YSP3YOR003W 1437 nt9.91□□□□□ -0.82
SSQ1Q05931 DUT1YBR252W 444 nt9.91□□□□□ -0.82
SSQ1Q05931 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.86□□□□□ -0.83
SSQ1Q05931 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.86□□□□□ -0.83
SSQ1Q05931 YNL115CYNL115C 1935 nt9.86□□□□□ -0.83
SSQ1Q05931 FRE6YLL051C 2139 nt9.85□□□□□ -0.83
SSQ1Q05931 PEX25YPL112C 1185 nt9.82□□□□□ -0.84
SSQ1Q05931 YCR102CYCR102C 1107 nt9.8□□□□□ -0.84
SSQ1Q05931 DAT1YML113W 747 nt9.8□□□□□ -0.84
SSQ1Q05931 RTN2YDL204W 1182 nt9.79□□□□□ -0.84
SSQ1Q05931 ESBP6YNL125C 2022 nt9.78□□□□□ -0.84
SSQ1Q05931 NIT1YIL164C 600 nt9.78□□□□□ -0.84
SSQ1Q05931 VPS75YNL246W 795 nt9.78□□□□□ -0.84
SSQ1Q05931 SGT2YOR007C 1041 nt9.78□□□□□ -0.84
SSQ1Q05931 YFL066CYFL066C 1179 nt9.76□□□□□ -0.85
SSQ1Q05931 PAU7YAR020C 168 nt9.75□□□□□ -0.85
SSQ1Q05931 NDI1YML120C 1542 nt9.75□□□□□ -0.85
SSQ1Q05931 HMG2YLR450W 3138 nt9.74□□□□□ -0.85
SSQ1Q05931 YFR018CYFR018C 1092 nt9.73□□□□□ -0.85
SSQ1Q05931 NBP35YGL091C 987 nt9.7□□□□□ -0.86
SSQ1Q05931 TPO4YOR273C 1980 nt9.7□□□□□ -0.86
SSQ1Q05931 ILV2YMR108W 2064 nt9.67□□□□□ -0.86
SSQ1Q05931 MAE1YKL029C 2010 nt9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms