Protein–RNA interactions for Protein: Q05919

VPS38, Vacuolar protein sorting-associated protein 38, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS38Q05919 ANP1YEL036C 1503 nt11.78□□□□□ -0.52
VPS38Q05919 YLR235CYLR235C 399 nt11.78□□□□□ -0.52
VPS38Q05919 AQY1YPR192W 918 nt11.77□□□□□ -0.53
VPS38Q05919 TIM23YNR017W 669 nt11.76□□□□□ -0.53
VPS38Q05919 FUR4YBR021W 1902 nt11.75□□□□□ -0.53
VPS38Q05919 GLK1YCL040W 1503 nt11.75□□□□□ -0.53
VPS38Q05919 YLR179CYLR179C 606 nt11.73□□□□□ -0.53
VPS38Q05919 STB1YNL309W 1263 nt11.73□□□□□ -0.53
VPS38Q05919 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.72□□□□□ -0.53
VPS38Q05919 SPC25YER018C 666 nt11.71□□□□□ -0.53
VPS38Q05919 MOT3YMR070W 1473 nt11.7□□□□□ -0.54
VPS38Q05919 BNA2YJR078W 1362 nt11.7□□□□□ -0.54
VPS38Q05919 FEN2YCR028C 1539 nt11.68□□□□□ -0.54
VPS38Q05919 GPI16YHR188C 1833 nt11.65□□□□□ -0.54
VPS38Q05919 MIC12YBR262C 321 nt11.65□□□□□ -0.54
VPS38Q05919 YKL030WYKL030W 606 nt11.63□□□□□ -0.55
VPS38Q05919 WSC2YNL283C 1512 nt11.63□□□□□ -0.55
VPS38Q05919 AHT1YHR093W 549 nt11.62□□□□□ -0.55
VPS38Q05919 VPS60YDR486C 690 nt11.61□□□□□ -0.55
VPS38Q05919 CCT4YDL143W 1587 nt11.6□□□□□ -0.55
VPS38Q05919 AGP1YCL025C 1902 nt11.6□□□□□ -0.55
VPS38Q05919 YIR016WYIR016W 798 nt11.59□□□□□ -0.55
VPS38Q05919 HHO1YPL127C 777 nt11.57□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 PRP4YPR178W 1398 nt11.56□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 ALG3YBL082C 1377 nt11.55□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.54□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 YEL076CYEL076C 651 nt11.54□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 YLR464WYLR464W 651 nt11.54□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 YPR064WYPR064W 420 nt11.54□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 SWC5YBR231C 912 nt11.53□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 ALG12YNR030W 1656 nt11.52□□□□□ -0.56
VPS38Q05919 DUS1YML080W 1272 nt11.52□□□□□ -0.57
VPS38Q05919 DPS1YLL018C 1674 nt11.49□□□□□ -0.57
VPS38Q05919 YCL074WYCL074W 927 nt11.47□□□□□ -0.57
VPS38Q05919 TAD3YLR316C 969 nt11.47□□□□□ -0.57
VPS38Q05919 YKR005CYKR005C 1578 nt11.46□□□□□ -0.57
VPS38Q05919 UME6YDR207C 2511 nt11.46□□□□□ -0.58
VPS38Q05919 YGR201CYGR201C 678 nt11.45□□□□□ -0.58
VPS38Q05919 AAC1YMR056C 930 nt11.45□□□□□ -0.58
VPS38Q05919 XDJ1YLR090W 1380 nt11.43□□□□□ -0.58
VPS38Q05919 RTG1YOL067C 534 nt11.43□□□□□ -0.58
VPS38Q05919 BMT6YLR063W 1098 nt11.41□□□□□ -0.58
VPS38Q05919 DUT1YBR252W 444 nt11.39□□□□□ -0.59
VPS38Q05919 YGR259CYGR259C 441 nt11.37□□□□□ -0.59
VPS38Q05919 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS38Q05919 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS38Q05919 BDH1YAL060W 1149 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS38Q05919 STR3YGL184C 1398 nt11.34□□□□□ -0.59
VPS38Q05919 AVT6YER119C 1347 nt11.34□□□□□ -0.59
VPS38Q05919 MCH5YOR306C 1566 nt11.33□□□□□ -0.6
VPS38Q05919 SNF1YDR477W 1902 nt11.33□□□□□ -0.6
VPS38Q05919 GDH3YAL062W 1374 nt11.32□□□□□ -0.6
VPS38Q05919 YLR415CYLR415C 339 nt11.3□□□□□ -0.6
VPS38Q05919 GOR1YNL274C 1053 nt11.3□□□□□ -0.6
VPS38Q05919 BIO5YNR056C 1686 nt11.28□□□□□ -0.6
VPS38Q05919 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.28□□□□□ -0.6
VPS38Q05919 IRC24YIR036C 792 nt11.26□□□□□ -0.61
VPS38Q05919 AQY2YLL052C 450 nt11.26□□□□□ -0.61
VPS38Q05919 SHM2YLR058C 1410 nt11.25□□□□□ -0.61
VPS38Q05919 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.22□□□□□ -0.61
VPS38Q05919 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.22□□□□□ -0.61
VPS38Q05919 NAR1YNL240C 1476 nt11.22□□□□□ -0.61
VPS38Q05919 HUA1YGR268C 597 nt11.21□□□□□ -0.61
VPS38Q05919 YSP3YOR003W 1437 nt11.2□□□□□ -0.62
VPS38Q05919 TIM17YJL143W 477 nt11.19□□□□□ -0.62
VPS38Q05919 RTN2YDL204W 1182 nt11.13□□□□□ -0.63
VPS38Q05919 NIT1YIL164C 600 nt11.13□□□□□ -0.63
VPS38Q05919 PBP1YGR178C 2169 nt11.13□□□□□ -0.63
VPS38Q05919 DAT1YML113W 747 nt11.1□□□□□ -0.63
VPS38Q05919 YNL115CYNL115C 1935 nt11.09□□□□□ -0.63
VPS38Q05919 MRPL8YJL063C 717 nt11.08□□□□□ -0.64
VPS38Q05919 CYT2YKL087C 675 nt11.07□□□□□ -0.64
VPS38Q05919 SGT2YOR007C 1041 nt11.07□□□□□ -0.64
VPS38Q05919 ADO1YJR105W 1023 nt11.05□□□□□ -0.64
VPS38Q05919 YCR102CYCR102C 1107 nt11.04□□□□□ -0.64
VPS38Q05919 NBP35YGL091C 987 nt11.04□□□□□ -0.64
VPS38Q05919 PEX25YPL112C 1185 nt11.03□□□□□ -0.64
VPS38Q05919 PLB1YMR008C 1995 nt10.99□□□□□ -0.65
VPS38Q05919 YFL066CYFL066C 1179 nt10.99□□□□□ -0.65
VPS38Q05919 ARP6YLR085C 1317 nt10.96□□□□□ -0.65
VPS38Q05919 VPS75YNL246W 795 nt10.96□□□□□ -0.65
VPS38Q05919 YFR018CYFR018C 1092 nt10.87□□□□□ -0.67
VPS38Q05919 PRM5YIL117C 957 nt10.87□□□□□ -0.67
VPS38Q05919 HIF1YLL022C 1158 nt10.84□□□□□ -0.67
VPS38Q05919 YAT1YAR035W 2064 nt10.84□□□□□ -0.67
VPS38Q05919 TIR3YIL011W 810 nt10.83□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 SHH4YLR164W 507 nt10.83□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 PRE6YOL038W 765 nt10.82□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 UTR1YJR049C 1593 nt10.82□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 ALD4YOR374W 1560 nt10.82□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 LSC2YGR244C 1284 nt10.8□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 PAU7YAR020C 168 nt10.8□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 GAP1YKR039W 1809 nt10.79□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 PRO1YDR300C 1287 nt10.78□□□□□ -0.68
VPS38Q05919 CMP2YML057W 1815 nt10.76□□□□□ -0.69
VPS38Q05919 YDR010CYDR010C 333 nt10.74□□□□□ -0.69
VPS38Q05919 POM34YLR018C 900 nt10.74□□□□□ -0.69
VPS38Q05919 SHB17YKR043C 816 nt10.72□□□□□ -0.69
VPS38Q05919 ATG15YCR068W 1563 nt10.69□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 NDI1YML120C 1542 nt10.69□□□□□ -0.7
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