Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 DDR2YOL052C-A 186 nt13.67□□□□□ -0.22
NSE3Q05541 ATF2YGR177C 1608 nt13.64□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 SPC25YER018C 666 nt13.64□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 YFL067WYFL067W 528 nt13.64□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.62□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 CCT4YDL143W 1587 nt13.62□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 YFL066CYFL066C 1179 nt13.61□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 BDH1YAL060W 1149 nt13.61□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 YLR415CYLR415C 339 nt13.6□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 PEX25YPL112C 1185 nt13.6□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 GUT2YIL155C 1950 nt13.6□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 GPI16YHR188C 1833 nt13.6□□□□□ -0.23
NSE3Q05541 CRR1YLR213C 1269 nt13.58□□□□□ -0.24
NSE3Q05541 YSP3YOR003W 1437 nt13.57□□□□□ -0.24
NSE3Q05541 NCP1YHR042W 2076 nt13.57□□□□□ -0.24
NSE3Q05541 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.56□□□□□ -0.24
NSE3Q05541 SWC5YBR231C 912 nt13.55□□□□□ -0.24
NSE3Q05541 VPS60YDR486C 690 nt13.54□□□□□ -0.24
NSE3Q05541 YNL115CYNL115C 1935 nt13.54□□□□□ -0.24
NSE3Q05541 BOP3YNL042W 1191 nt13.52□□□□□ -0.25
NSE3Q05541 FEN2YCR028C 1539 nt13.49□□□□□ -0.25
NSE3Q05541 ANP1YEL036C 1503 nt13.48□□□□□ -0.25
NSE3Q05541 SNG1YGR197C 1644 nt13.47□□□□□ -0.25
NSE3Q05541 HEM12YDR047W 1089 nt13.47□□□□□ -0.25
NSE3Q05541 RTF1YGL244W 1677 nt13.47□□□□□ -0.25
NSE3Q05541 ALG3YBL082C 1377 nt13.46□□□□□ -0.25
NSE3Q05541 LYS4YDR234W 2082 nt13.46□□□□□ -0.26
NSE3Q05541 MIC10YCL057C-A 294 nt13.43□□□□□ -0.26
NSE3Q05541 NAT4YMR069W 858 nt13.41□□□□□ -0.26
NSE3Q05541 SBA1YKL117W 651 nt13.39□□□□□ -0.27
NSE3Q05541 GLK1YCL040W 1503 nt13.39□□□□□ -0.27
NSE3Q05541 PIB2YGL023C 1908 nt13.37□□□□□ -0.27
NSE3Q05541 YIR016WYIR016W 798 nt13.37□□□□□ -0.27
NSE3Q05541 SPT8YLR055C 1809 nt13.35□□□□□ -0.27
NSE3Q05541 VPS75YNL246W 795 nt13.35□□□□□ -0.27
NSE3Q05541 MIR1YJR077C 936 nt13.28□□□□□ -0.28
NSE3Q05541 THI74YDR438W 1113 nt13.27□□□□□ -0.29
NSE3Q05541 MSF1YPR047W 1410 nt13.27□□□□□ -0.29
NSE3Q05541 TIM17YJL143W 477 nt13.26□□□□□ -0.29
NSE3Q05541 BNA2YJR078W 1362 nt13.24□□□□□ -0.29
NSE3Q05541 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.23□□□□□ -0.29
NSE3Q05541 PTK1YKL198C 1989 nt13.23□□□□□ -0.29
NSE3Q05541 PAU7YAR020C 168 nt13.22□□□□□ -0.29
NSE3Q05541 SHM2YLR058C 1410 nt13.17□□□□□ -0.3
NSE3Q05541 XDJ1YLR090W 1380 nt13.16□□□□□ -0.3
NSE3Q05541 RAX1YOR301W 1308 nt13.15□□□□□ -0.3
NSE3Q05541 MIC12YBR262C 321 nt13.14□□□□□ -0.31
NSE3Q05541 DAT1YML113W 747 nt13.13□□□□□ -0.31
NSE3Q05541 YFL054CYFL054C 1941 nt13.09□□□□□ -0.31
NSE3Q05541 GDH3YAL062W 1374 nt13.08□□□□□ -0.31
NSE3Q05541 HHO1YPL127C 777 nt13.08□□□□□ -0.32
NSE3Q05541 UBA4YHR111W 1323 nt13.07□□□□□ -0.32
NSE3Q05541 SHB17YKR043C 816 nt13.06□□□□□ -0.32
NSE3Q05541 SGT2YOR007C 1041 nt13.05□□□□□ -0.32
NSE3Q05541 YGL034CYGL034C 366 nt13.03□□□□□ -0.32
NSE3Q05541 YGR201CYGR201C 678 nt13.03□□□□□ -0.32
NSE3Q05541 NIT1YIL164C 600 nt13.03□□□□□ -0.32
NSE3Q05541 YSR3YKR053C 1215 nt13.01□□□□□ -0.33
NSE3Q05541 YDR010CYDR010C 333 nt12.96□□□□□ -0.33
NSE3Q05541 AVT6YER119C 1347 nt12.95□□□□□ -0.34
NSE3Q05541 XYL2YLR070C 1071 nt12.92□□□□□ -0.34
NSE3Q05541 YMR244WYMR244W 1068 nt12.91□□□□□ -0.34
NSE3Q05541 GOR1YNL274C 1053 nt12.9□□□□□ -0.34
NSE3Q05541 GLR1YPL091W 1452 nt12.89□□□□□ -0.35
NSE3Q05541 PHO89YBR296C 1725 nt12.88□□□□□ -0.35
NSE3Q05541 RET2YFR051C 1641 nt12.88□□□□□ -0.35
NSE3Q05541 NDI1YML120C 1542 nt12.87□□□□□ -0.35
NSE3Q05541 RBG1YAL036C 1110 nt12.86□□□□□ -0.35
NSE3Q05541 YCR087WYCR087W 516 nt12.85□□□□□ -0.35
NSE3Q05541 CCA1YER168C 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
NSE3Q05541 AGP1YCL025C 1902 nt12.82□□□□□ -0.36
NSE3Q05541 DUT1YBR252W 444 nt12.8□□□□□ -0.36
NSE3Q05541 YCR102CYCR102C 1107 nt12.79□□□□□ -0.36
NSE3Q05541 SWE1YJL187C 2460 nt12.79□□□□□ -0.36
NSE3Q05541 AIM45YPR004C 1035 nt12.78□□□□□ -0.36
NSE3Q05541 MRP20YDR405W 792 nt12.75□□□□□ -0.37
NSE3Q05541 COQ2YNR041C 1119 nt12.7□□□□□ -0.38
NSE3Q05541 SFA1YDL168W 1161 nt12.68□□□□□ -0.38
NSE3Q05541 RBG2YGR173W 1107 nt12.68□□□□□ -0.38
NSE3Q05541 DUS1YML080W 1272 nt12.68□□□□□ -0.38
NSE3Q05541 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.65□□□□□ -0.38
NSE3Q05541 NBP35YGL091C 987 nt12.61□□□□□ -0.39
NSE3Q05541 YMR226CYMR226C 804 nt12.6□□□□□ -0.39
NSE3Q05541 YJL225CYJL225C 5277 nt12.58□□□□□ -0.4
NSE3Q05541 TIR3YIL011W 810 nt12.57□□□□□ -0.4
NSE3Q05541 AQY2YLL052C 450 nt12.57□□□□□ -0.4
NSE3Q05541 RPL4BYDR012W 1089 nt12.56□□□□□ -0.4
NSE3Q05541 SHH4YLR164W 507 nt12.56□□□□□ -0.4
NSE3Q05541 RPL4AYBR031W 1089 nt12.56□□□□□ -0.4
NSE3Q05541 STR3YGL184C 1398 nt12.56□□□□□ -0.4
NSE3Q05541 CLB6YGR109C 1143 nt12.54□□□□□ -0.4
NSE3Q05541 YCL074WYCL074W 927 nt12.51□□□□□ -0.41
NSE3Q05541 YLR111WYLR111W 333 nt12.51□□□□□ -0.41
NSE3Q05541 TOM6YOR045W 186 nt12.49□□□□□ -0.41
NSE3Q05541 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.48□□□□□ -0.41
NSE3Q05541 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.48□□□□□ -0.41
NSE3Q05541 SDH5YOL071W 489 nt12.48□□□□□ -0.41
NSE3Q05541 RPS14BYJL191W 417 nt12.47□□□□□ -0.41
NSE3Q05541 UTH1YKR042W 1098 nt12.46□□□□□ -0.41
NSE3Q05541 POM34YLR018C 900 nt12.46□□□□□ -0.41
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