Protein–RNA interactions for Protein: Q05022

RRP5, rRNA biogenesis protein RRP5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP5Q05022 AQY1YPR192W 918 nt14.38□□□□□ -0.11
RRP5Q05022 VPS75YNL246W 795 nt14.38□□□□□ -0.11
RRP5Q05022 BIO4YNR057C 714 nt14.38□□□□□ -0.11
RRP5Q05022 RBG2YGR173W 1107 nt14.35□□□□□ -0.11
RRP5Q05022 SWC5YBR231C 912 nt14.29□□□□□ -0.12
RRP5Q05022 GAL1YBR020W 1587 nt14.29□□□□□ -0.12
RRP5Q05022 TRM5YHR070W 1500 nt14.29□□□□□ -0.12
RRP5Q05022 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt14.27□□□□□ -0.12
RRP5Q05022 YHL050CYHL050C 2094 nt14.26□□□□□ -0.13
RRP5Q05022 CCT4YDL143W 1587 nt14.26□□□□□ -0.13
RRP5Q05022 YNL195CYNL195C 786 nt14.25□□□□□ -0.13
RRP5Q05022 SPC25YER018C 666 nt14.22□□□□□ -0.13
RRP5Q05022 ATF2YGR177C 1608 nt14.22□□□□□ -0.13
RRP5Q05022 DAT1YML113W 747 nt14.2□□□□□ -0.14
RRP5Q05022 STB1YNL309W 1263 nt14.2□□□□□ -0.14
RRP5Q05022 NDI1YML120C 1542 nt14.19□□□□□ -0.14
RRP5Q05022 GPI16YHR188C 1833 nt14.18□□□□□ -0.14
RRP5Q05022 ALG3YBL082C 1377 nt14.16□□□□□ -0.14
RRP5Q05022 VPS60YDR486C 690 nt14.14□□□□□ -0.15
RRP5Q05022 SPT8YLR055C 1809 nt14.13□□□□□ -0.15
RRP5Q05022 DDR2YOL052C-A 186 nt14.12□□□□□ -0.15
RRP5Q05022 SIM1YIL123W 1431 nt14.11□□□□□ -0.15
RRP5Q05022 PAU7YAR020C 168 nt14.1□□□□□ -0.15
RRP5Q05022 YGL034CYGL034C 366 nt14.1□□□□□ -0.15
RRP5Q05022 UBA4YHR111W 1323 nt14.08□□□□□ -0.16
RRP5Q05022 RBG1YAL036C 1110 nt14.07□□□□□ -0.16
RRP5Q05022 RAD51YER095W 1203 nt14.07□□□□□ -0.16
RRP5Q05022 SHB17YKR043C 816 nt14.05□□□□□ -0.16
RRP5Q05022 CRR1YLR213C 1269 nt14.03□□□□□ -0.16
RRP5Q05022 YFL067WYFL067W 528 nt14.02□□□□□ -0.16
RRP5Q05022 TIM17YJL143W 477 nt14□□□□□ -0.17
RRP5Q05022 ERF2YLR246W 1080 nt14□□□□□ -0.17
RRP5Q05022 XYL2YLR070C 1071 nt13.99□□□□□ -0.17
RRP5Q05022 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.97□□□□□ -0.17
RRP5Q05022 ANP1YEL036C 1503 nt13.95□□□□□ -0.18
RRP5Q05022 MIC10YCL057C-A 294 nt13.93□□□□□ -0.18
RRP5Q05022 YDR010CYDR010C 333 nt13.93□□□□□ -0.18
RRP5Q05022 SGT2YOR007C 1041 nt13.9□□□□□ -0.18
RRP5Q05022 FEN2YCR028C 1539 nt13.89□□□□□ -0.19
RRP5Q05022 SAM1YLR180W 1149 nt13.88□□□□□ -0.19
RRP5Q05022 YSR3YKR053C 1215 nt13.86□□□□□ -0.19
RRP5Q05022 AIM45YPR004C 1035 nt13.85□□□□□ -0.19
RRP5Q05022 BDF1YLR399C 2061 nt13.83□□□□□ -0.2
RRP5Q05022 RPM1RPM1 483 nt13.81□□□□□ -0.2
RRP5Q05022 RET2YFR051C 1641 nt13.8□□□□□ -0.2
RRP5Q05022 TAT1YBR069C 1860 nt13.8□□□□□ -0.2
RRP5Q05022 SHM2YLR058C 1410 nt13.78□□□□□ -0.2
RRP5Q05022 SNG1YGR197C 1644 nt13.77□□□□□ -0.2
RRP5Q05022 PHO89YBR296C 1725 nt13.77□□□□□ -0.2
RRP5Q05022 YIR016WYIR016W 798 nt13.75□□□□□ -0.21
RRP5Q05022 SEC11YIR022W 504 nt13.73□□□□□ -0.21
RRP5Q05022 YNR029CYNR029C 1290 nt13.72□□□□□ -0.21
RRP5Q05022 NIT1YIL164C 600 nt13.71□□□□□ -0.21
RRP5Q05022 YCR087WYCR087W 516 nt13.7□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 LYS4YDR234W 2082 nt13.7□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 YLR111WYLR111W 333 nt13.7□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 PCH2YBR186W 1695 nt13.69□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 YMR226CYMR226C 804 nt13.69□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 XDJ1YLR090W 1380 nt13.69□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 SDH5YOL071W 489 nt13.67□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 NCP1YHR042W 2076 nt13.67□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 ADH7YCR105W 1086 nt13.66□□□□□ -0.22
RRP5Q05022 HEM12YDR047W 1089 nt13.64□□□□□ -0.23
RRP5Q05022 COQ2YNR041C 1119 nt13.63□□□□□ -0.23
RRP5Q05022 YLR349WYLR349W 507 nt13.61□□□□□ -0.23
RRP5Q05022 CAB5YDR196C 726 nt13.6□□□□□ -0.23
RRP5Q05022 GUT2YIL155C 1950 nt13.54□□□□□ -0.24
RRP5Q05022 STE4YOR212W 1272 nt13.53□□□□□ -0.24
RRP5Q05022 YLR279WYLR279W 390 nt13.53□□□□□ -0.24
RRP5Q05022 PIB2YGL023C 1908 nt13.52□□□□□ -0.25
RRP5Q05022 RTF1YGL244W 1677 nt13.51□□□□□ -0.25
RRP5Q05022 BOP3YNL042W 1191 nt13.5□□□□□ -0.25
RRP5Q05022 MRP20YDR405W 792 nt13.49□□□□□ -0.25
RRP5Q05022 PAU15YIR041W 375 nt13.49□□□□□ -0.25
RRP5Q05022 RPS14BYJL191W 417 nt13.45□□□□□ -0.26
RRP5Q05022 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.45□□□□□ -0.26
RRP5Q05022 GDH3YAL062W 1374 nt13.45□□□□□ -0.26
RRP5Q05022 YGR201CYGR201C 678 nt13.44□□□□□ -0.26
RRP5Q05022 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt13.44□□□□□ -0.26
RRP5Q05022 SFA1YDL168W 1161 nt13.43□□□□□ -0.26
RRP5Q05022 MIC12YBR262C 321 nt13.43□□□□□ -0.26
RRP5Q05022 BNA2YJR078W 1362 nt13.37□□□□□ -0.27
RRP5Q05022 RPL4BYDR012W 1089 nt13.36□□□□□ -0.27
RRP5Q05022 RPL4AYBR031W 1089 nt13.36□□□□□ -0.27
RRP5Q05022 AVT6YER119C 1347 nt13.34□□□□□ -0.27
RRP5Q05022 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.34□□□□□ -0.27
RRP5Q05022 RAD23YEL037C 1197 nt13.32□□□□□ -0.28
RRP5Q05022 FUN14YAL008W 597 nt13.3□□□□□ -0.28
RRP5Q05022 YGR012WYGR012W 1182 nt13.28□□□□□ -0.28
RRP5Q05022 PTK1YKL198C 1989 nt13.27□□□□□ -0.29
RRP5Q05022 HHO1YPL127C 777 nt13.25□□□□□ -0.29
RRP5Q05022 AGP1YCL025C 1902 nt13.24□□□□□ -0.29
RRP5Q05022 YFL054CYFL054C 1941 nt13.21□□□□□ -0.29
RRP5Q05022 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt13.19□□□□□ -0.3
RRP5Q05022 TSC10YBR265W 963 nt13.19□□□□□ -0.3
RRP5Q05022 GPN2YOR262W 1044 nt13.16□□□□□ -0.3
RRP5Q05022 SHH4YLR164W 507 nt13.16□□□□□ -0.3
RRP5Q05022 ADH1YOL086C 1047 nt13.15□□□□□ -0.3
RRP5Q05022 CLB6YGR109C 1143 nt13.14□□□□□ -0.31
RRP5Q05022 MSB4YOL112W 1479 nt13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.5 ms