Protein–RNA interactions for Protein: Q04839

GFD1, mRNA transport factor GFD1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GFD1Q04839 ANP1YEL036C 1503 nt12.01□□□□□ -0.49
GFD1Q04839 STB1YNL309W 1263 nt12.01□□□□□ -0.49
GFD1Q04839 RAX1YOR301W 1308 nt12.01□□□□□ -0.49
GFD1Q04839 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12□□□□□ -0.49
GFD1Q04839 SPC25YER018C 666 nt11.99□□□□□ -0.49
GFD1Q04839 WSC2YNL283C 1512 nt11.97□□□□□ -0.49
GFD1Q04839 AHT1YHR093W 549 nt11.96□□□□□ -0.49
GFD1Q04839 RTG1YOL067C 534 nt11.96□□□□□ -0.49
GFD1Q04839 GPI16YHR188C 1833 nt11.95□□□□□ -0.5
GFD1Q04839 FEN2YCR028C 1539 nt11.93□□□□□ -0.5
GFD1Q04839 YPR064WYPR064W 420 nt11.93□□□□□ -0.5
GFD1Q04839 BNA2YJR078W 1362 nt11.92□□□□□ -0.5
GFD1Q04839 CCA1YER168C 1641 nt11.91□□□□□ -0.5
GFD1Q04839 NVJ2YPR091C 2313 nt11.9□□□□□ -0.5
GFD1Q04839 CCT4YDL143W 1587 nt11.89□□□□□ -0.51
GFD1Q04839 VPS60YDR486C 690 nt11.89□□□□□ -0.51
GFD1Q04839 MIC12YBR262C 321 nt11.86□□□□□ -0.51
GFD1Q04839 TAD3YLR316C 969 nt11.85□□□□□ -0.51
GFD1Q04839 BOR1YNL275W 1731 nt11.84□□□□□ -0.51
GFD1Q04839 SWC5YBR231C 912 nt11.84□□□□□ -0.51
GFD1Q04839 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.83□□□□□ -0.52
GFD1Q04839 YEL076CYEL076C 651 nt11.83□□□□□ -0.52
GFD1Q04839 YLR464WYLR464W 651 nt11.83□□□□□ -0.52
GFD1Q04839 ALG3YBL082C 1377 nt11.82□□□□□ -0.52
GFD1Q04839 YIR016WYIR016W 798 nt11.82□□□□□ -0.52
GFD1Q04839 HUA1YGR268C 597 nt11.77□□□□□ -0.53
GFD1Q04839 HSP60YLR259C 1719 nt11.77□□□□□ -0.53
GFD1Q04839 FUR4YBR021W 1902 nt11.76□□□□□ -0.53
GFD1Q04839 HHO1YPL127C 777 nt11.75□□□□□ -0.53
GFD1Q04839 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.74□□□□□ -0.53
GFD1Q04839 MRPL8YJL063C 717 nt11.74□□□□□ -0.53
GFD1Q04839 AGP1YCL025C 1902 nt11.74□□□□□ -0.53
GFD1Q04839 GLK1YCL040W 1503 nt11.72□□□□□ -0.53
GFD1Q04839 ADO1YJR105W 1023 nt11.7□□□□□ -0.54
GFD1Q04839 YGR201CYGR201C 678 nt11.69□□□□□ -0.54
GFD1Q04839 BDH1YAL060W 1149 nt11.69□□□□□ -0.54
GFD1Q04839 YLR415CYLR415C 339 nt11.66□□□□□ -0.54
GFD1Q04839 DUS1YML080W 1272 nt11.65□□□□□ -0.54
GFD1Q04839 XDJ1YLR090W 1380 nt11.63□□□□□ -0.55
GFD1Q04839 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.59□□□□□ -0.55
GFD1Q04839 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.59□□□□□ -0.55
GFD1Q04839 YCL074WYCL074W 927 nt11.59□□□□□ -0.55
GFD1Q04839 YSP3YOR003W 1437 nt11.58□□□□□ -0.56
GFD1Q04839 GDH3YAL062W 1374 nt11.56□□□□□ -0.56
GFD1Q04839 PRP4YPR178W 1398 nt11.55□□□□□ -0.56
GFD1Q04839 AVT6YER119C 1347 nt11.55□□□□□ -0.56
GFD1Q04839 DUT1YBR252W 444 nt11.54□□□□□ -0.56
GFD1Q04839 SHM2YLR058C 1410 nt11.53□□□□□ -0.56
GFD1Q04839 TIM17YJL143W 477 nt11.52□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 GOR1YNL274C 1053 nt11.52□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 YKR005CYKR005C 1578 nt11.5□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 Q0182Q0182 405 nt11.49□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 DPS1YLL018C 1674 nt11.48□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 YNL115CYNL115C 1935 nt11.48□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.47□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.47□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 PEX25YPL112C 1185 nt11.47□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 STR3YGL184C 1398 nt11.46□□□□□ -0.57
GFD1Q04839 BMT6YLR063W 1098 nt11.45□□□□□ -0.58
GFD1Q04839 YGR259CYGR259C 441 nt11.42□□□□□ -0.58
GFD1Q04839 AQY2YLL052C 450 nt11.42□□□□□ -0.58
GFD1Q04839 AAC1YMR056C 930 nt11.42□□□□□ -0.58
GFD1Q04839 NIT1YIL164C 600 nt11.41□□□□□ -0.58
GFD1Q04839 YFL066CYFL066C 1179 nt11.39□□□□□ -0.59
GFD1Q04839 ALG12YNR030W 1656 nt11.39□□□□□ -0.59
GFD1Q04839 DAT1YML113W 747 nt11.38□□□□□ -0.59
GFD1Q04839 YFR018CYFR018C 1092 nt11.37□□□□□ -0.59
GFD1Q04839 SGT2YOR007C 1041 nt11.37□□□□□ -0.59
GFD1Q04839 VPS75YNL246W 795 nt11.35□□□□□ -0.59
GFD1Q04839 SNF1YDR477W 1902 nt11.31□□□□□ -0.6
GFD1Q04839 YCR102CYCR102C 1107 nt11.29□□□□□ -0.6
GFD1Q04839 RTN2YDL204W 1182 nt11.29□□□□□ -0.6
GFD1Q04839 PRE6YOL038W 765 nt11.29□□□□□ -0.6
GFD1Q04839 IRC24YIR036C 792 nt11.28□□□□□ -0.6
GFD1Q04839 YDR094WYDR094W 336 nt11.27□□□□□ -0.61
GFD1Q04839 NBP35YGL091C 987 nt11.24□□□□□ -0.61
GFD1Q04839 BIO5YNR056C 1686 nt11.22□□□□□ -0.61
GFD1Q04839 RRT5YFR032C 870 nt11.2□□□□□ -0.62
GFD1Q04839 PAU7YAR020C 168 nt11.2□□□□□ -0.62
GFD1Q04839 UME6YDR207C 2511 nt11.17□□□□□ -0.62
GFD1Q04839 MCH5YOR306C 1566 nt11.14□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 PLB1YMR008C 1995 nt11.14□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 ARP6YLR085C 1317 nt11.13□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 PAU16YKL224C 372 nt11.12□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 TIR3YIL011W 810 nt11.1□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 UBX6YJL048C 1191 nt11.1□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 SHB17YKR043C 816 nt11.1□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 NAR1YNL240C 1476 nt11.1□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 MIR1YJR077C 936 nt11.09□□□□□ -0.63
GFD1Q04839 YDR010CYDR010C 333 nt11.07□□□□□ -0.64
GFD1Q04839 SHH4YLR164W 507 nt11.06□□□□□ -0.64
GFD1Q04839 PBP1YGR178C 2169 nt11.04□□□□□ -0.64
GFD1Q04839 LSC2YGR244C 1284 nt11.04□□□□□ -0.64
GFD1Q04839 RET2YFR051C 1641 nt11□□□□□ -0.65
GFD1Q04839 PRO1YDR300C 1287 nt11□□□□□ -0.65
GFD1Q04839 THI74YDR438W 1113 nt10.99□□□□□ -0.65
GFD1Q04839 GAP1YKR039W 1809 nt10.99□□□□□ -0.65
GFD1Q04839 UBA4YHR111W 1323 nt10.99□□□□□ -0.65
GFD1Q04839 SFA1YDL168W 1161 nt10.98□□□□□ -0.65
GFD1Q04839 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.98□□□□□ -0.65
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