Protein–RNA interactions for Protein: Q03012

SPP1, COMPASS component SPP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPP1Q03012 FRD1YEL047C 1413 nt12.36□□□□□ -0.43
SPP1Q03012 SKI6YGR195W 741 nt12.35□□□□□ -0.43
SPP1Q03012 YDR094WYDR094W 336 nt12.33□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 YLR036CYLR036C 612 nt12.33□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 RRD1YIL153W 1182 nt12.32□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 DCW1YKL046C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 FPS1YLL043W 2010 nt12.3□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 NUF2YOL069W 1356 nt12.3□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 MPS2YGL075C 1164 nt12.29□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 ARC19YKL013C 516 nt12.29□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 YOL150CYOL150C 312 nt12.29□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 RTS2YOR077W 699 nt12.29□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 RUF21RUF21 707 nt12.28□□□□□ -0.44
SPP1Q03012 PTH1YHR189W 573 nt12.27□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 IDI1YPL117C 867 nt12.27□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 YNL040WYNL040W 1371 nt12.26□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.25□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 LCP5YER127W 1074 nt12.24□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 UBC12YLR306W 567 nt12.24□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 ARP6YLR085C 1317 nt12.22□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 YEL074WYEL074W 339 nt12.22□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 BI2Q0110 1272 nt12.22□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 FMT1YBL013W 1206 nt12.22□□□□□ -0.45
SPP1Q03012 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt12.2□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 COX3Q0275 810 nt12.2□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 TGS1YPL157W 948 nt12.2□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 VPS28YPL065W 729 nt12.19□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 SOR2YDL246C 1074 nt12.18□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 YPR1YDR368W 939 nt12.18□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt12.18□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 SOR1YJR159W 1074 nt12.18□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 RER1YCL001W 567 nt12.18□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 SSA4YER103W 1929 nt12.17□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 YKL030WYKL030W 606 nt12.16□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 YML079WYML079W 606 nt12.16□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 ZTA1YBR046C 1005 nt12.16□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 IRC15YPL017C 1500 nt12.16□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 YCL042WYCL042W 360 nt12.15□□□□□ -0.46
SPP1Q03012 THP3YPR045C 1413 nt12.14□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 YGR011WYGR011W 327 nt12.13□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 TSR2YLR435W 618 nt12.13□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt12.12□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 RSA3YLR221C 663 nt12.12□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 YLR235CYLR235C 399 nt12.12□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 EMI2YDR516C 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 LCB1YMR296C 1677 nt12.11□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 YJL107CYJL107C 1164 nt12.1□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 CUE1YMR264W 612 nt12.1□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 MET8YBR213W 825 nt12.1□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 URH1YDR400W 1023 nt12.09□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 YHR054CYHR054C 1065 nt12.09□□□□□ -0.47
SPP1Q03012 FIP1YJR093C 984 nt12.08□□□□□ -0.48
SPP1Q03012 MCT1YOR221C 1083 nt12.08□□□□□ -0.48
SPP1Q03012 TAZ1YPR140W 1146 nt12.08□□□□□ -0.48
SPP1Q03012 YDL221WYDL221W 552 nt12.07□□□□□ -0.48
SPP1Q03012 ECM9YKR004C 1134 nt12.06□□□□□ -0.48
SPP1Q03012 YLR283WYLR283W 945 nt12.05□□□□□ -0.48
SPP1Q03012 GIS3YLR094C 1509 nt12.03□□□□□ -0.48
SPP1Q03012 SCEIQ0160 708 nt12.02□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 CWP1YKL096W 720 nt12.02□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 YMR144WYMR144W 1029 nt12.02□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 DIA1YMR316W 1011 nt12.01□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 SUT2YPR009W 807 nt12.01□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 CBS1YDL069C 690 nt11.99□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 FMP52YER004W 696 nt11.99□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 SUT1YGL162W 900 nt11.99□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 ADH2YMR303C 1047 nt11.99□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 MOD5YOR274W 1287 nt11.99□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 RAD17YOR368W 1206 nt11.99□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 YDL157CYDL157C 357 nt11.97□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 MPC1YGL080W 393 nt11.97□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.97□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 PAU16YKL224C 372 nt11.96□□□□□ -0.49
SPP1Q03012 CSI1YMR025W 888 nt11.95□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 YHM2YMR241W 945 nt11.95□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt11.95□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 PRM4YPL156C 855 nt11.95□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 ERV29YGR284C 933 nt11.94□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 YLR311CYLR311C 348 nt11.94□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 RSM23YGL129C 1353 nt11.93□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 YDL158CYDL158C 309 nt11.92□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 CLB6YGR109C 1143 nt11.91□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 YIL100WYIL100W 354 nt11.91□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 SBA1YKL117W 651 nt11.91□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 DIC1YLR348C 897 nt11.91□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 TIM23YNR017W 669 nt11.91□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 CCE1YKL011C 1062 nt11.9□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 MSA2YKR077W 1092 nt11.9□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 PRE6YOL038W 765 nt11.9□□□□□ -0.5
SPP1Q03012 HMRA1YCR097W 381 nt11.89□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 YFR018CYFR018C 1092 nt11.88□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.88□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 YMR090WYMR090W 684 nt11.88□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 ERG12YMR208W 1332 nt11.87□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 YGR168CYGR168C 1131 nt11.86□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 YHR145CYHR145C 357 nt11.86□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 SED5YLR026C 1023 nt11.86□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 ERG29YMR134W 714 nt11.86□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 CHA1YCL064C 1083 nt11.85□□□□□ -0.51
SPP1Q03012 PCL6YER059W 1263 nt11.85□□□□□ -0.51
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