Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 BIO4YNR057C 714 nt9.46□□□□□ -0.9
SKO1Q02100 SIM1YIL123W 1431 nt9.46□□□□□ -0.9
SKO1Q02100 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.44□□□□□ -0.9
SKO1Q02100 YLL053CYLL053C 459 nt9.44□□□□□ -0.9
SKO1Q02100 YPR064WYPR064W 420 nt9.43□□□□□ -0.9
SKO1Q02100 AHT1YHR093W 549 nt9.42□□□□□ -0.9
SKO1Q02100 WSC2YNL283C 1512 nt9.41□□□□□ -0.9
SKO1Q02100 ALG12YNR030W 1656 nt9.4□□□□□ -0.9
SKO1Q02100 FTR1YER145C 1215 nt9.39□□□□□ -0.91
SKO1Q02100 TAD3YLR316C 969 nt9.39□□□□□ -0.91
SKO1Q02100 AQY1YPR192W 918 nt9.39□□□□□ -0.91
SKO1Q02100 MCH5YOR306C 1566 nt9.37□□□□□ -0.91
SKO1Q02100 GAL1YBR020W 1587 nt9.36□□□□□ -0.91
SKO1Q02100 YFR018CYFR018C 1092 nt9.35□□□□□ -0.91
SKO1Q02100 GLK1YCL040W 1503 nt9.34□□□□□ -0.91
SKO1Q02100 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.33□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 TRM5YHR070W 1500 nt9.32□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 CRR1YLR213C 1269 nt9.31□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 ERF2YLR246W 1080 nt9.31□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 FUR4YBR021W 1902 nt9.29□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.29□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 ATF2YGR177C 1608 nt9.29□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 SPC25YER018C 666 nt9.28□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 YFL067WYFL067W 528 nt9.28□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 STB1YNL309W 1263 nt9.28□□□□□ -0.92
SKO1Q02100 RRT5YFR032C 870 nt9.26□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 PAU16YKL224C 372 nt9.26□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 DDR2YOL052C-A 186 nt9.26□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 FRE6YLL051C 2139 nt9.26□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 BDH1YAL060W 1149 nt9.25□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 PRE6YOL038W 765 nt9.25□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.24□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 CCT4YDL143W 1587 nt9.24□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 GPI16YHR188C 1833 nt9.23□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 CCA1YER168C 1641 nt9.23□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.22□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 PEX25YPL112C 1185 nt9.22□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 MIC10YCL057C-A 294 nt9.22□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 YSP3YOR003W 1437 nt9.22□□□□□ -0.93
SKO1Q02100 YLR415CYLR415C 339 nt9.2□□□□□ -0.94
SKO1Q02100 VPS60YDR486C 690 nt9.19□□□□□ -0.94
SKO1Q02100 ANP1YEL036C 1503 nt9.19□□□□□ -0.94
SKO1Q02100 YFL066CYFL066C 1179 nt9.18□□□□□ -0.94
SKO1Q02100 SNG1YGR197C 1644 nt9.16□□□□□ -0.94
SKO1Q02100 FEN2YCR028C 1539 nt9.16□□□□□ -0.94
SKO1Q02100 HEM12YDR047W 1089 nt9.16□□□□□ -0.94
SKO1Q02100 SWC5YBR231C 912 nt9.16□□□□□ -0.94
SKO1Q02100 YNL115CYNL115C 1935 nt9.15□□□□□ -0.95
SKO1Q02100 ALG3YBL082C 1377 nt9.14□□□□□ -0.95
SKO1Q02100 PRP4YPR178W 1398 nt9.14□□□□□ -0.95
SKO1Q02100 RAX1YOR301W 1308 nt9.13□□□□□ -0.95
SKO1Q02100 DPS1YLL018C 1674 nt9.13□□□□□ -0.95
SKO1Q02100 SNF1YDR477W 1902 nt9.1□□□□□ -0.95
SKO1Q02100 AAC1YMR056C 930 nt9.1□□□□□ -0.95
SKO1Q02100 PBP1YGR178C 2169 nt9.09□□□□□ -0.95
SKO1Q02100 BIO5YNR056C 1686 nt9.08□□□□□ -0.96
SKO1Q02100 YIR016WYIR016W 798 nt9.08□□□□□ -0.96
SKO1Q02100 NAR1YNL240C 1476 nt9.07□□□□□ -0.96
SKO1Q02100 AGP1YCL025C 1902 nt9.06□□□□□ -0.96
SKO1Q02100 VPS75YNL246W 795 nt9.05□□□□□ -0.96
SKO1Q02100 YKR005CYKR005C 1578 nt9.03□□□□□ -0.96
SKO1Q02100 NAT4YMR069W 858 nt9.01□□□□□ -0.97
SKO1Q02100 MIC12YBR262C 321 nt9.01□□□□□ -0.97
SKO1Q02100 MIR1YJR077C 936 nt8.98□□□□□ -0.97
SKO1Q02100 SBA1YKL117W 651 nt8.98□□□□□ -0.97
SKO1Q02100 TIM17YJL143W 477 nt8.97□□□□□ -0.97
SKO1Q02100 BNA2YJR078W 1362 nt8.97□□□□□ -0.97
SKO1Q02100 THI74YDR438W 1113 nt8.94□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 CYT2YKL087C 675 nt8.94□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 MSF1YPR047W 1410 nt8.94□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 XDJ1YLR090W 1380 nt8.93□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 SHM2YLR058C 1410 nt8.93□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 HSL7YBR133C 2484 nt8.92□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 SSN3YPL042C 1668 nt8.91□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 YCL074WYCL074W 927 nt8.91□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 BMT6YLR063W 1098 nt8.91□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 YGR259CYGR259C 441 nt8.9□□□□□ -0.98
SKO1Q02100 IRC24YIR036C 792 nt8.89□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 PAU7YAR020C 168 nt8.89□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 YGR201CYGR201C 678 nt8.88□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.87□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.87□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.87□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.87□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 NIT1YIL164C 600 nt8.87□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 GDH3YAL062W 1374 nt8.86□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 DAT1YML113W 747 nt8.86□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 HHO1YPL127C 777 nt8.86□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 SGT2YOR007C 1041 nt8.84□□□□□ -0.99
SKO1Q02100 SHB17YKR043C 816 nt8.83□□□□□ -1
SKO1Q02100 UBA4YHR111W 1323 nt8.82□□□□□ -1
SKO1Q02100 DUS1YML080W 1272 nt8.8□□□□□ -1
SKO1Q02100 DUT1YBR252W 444 nt8.8□□□□□ -1
SKO1Q02100 STR3YGL184C 1398 nt8.8□□□□□ -1
SKO1Q02100 YAT1YAR035W 2064 nt8.79□□□□□ -1
SKO1Q02100 YDR010CYDR010C 333 nt8.79□□□□□ -1
SKO1Q02100 YGL034CYGL034C 366 nt8.78□□□□□ -1
SKO1Q02100 AVT6YER119C 1347 nt8.77□□□□□ -1.01
SKO1Q02100 YSR3YKR053C 1215 nt8.76□□□□□ -1.01
SKO1Q02100 BSP1YPR171W 1731 nt8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.9 ms