Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 HEM12YDR047W 1089 nt10.1□□□□□ -0.79
CIK1Q01649 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.1□□□□□ -0.79
CIK1Q01649 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.1□□□□□ -0.79
CIK1Q01649 CWP1YKL096W 720 nt10.09□□□□□ -0.79
CIK1Q01649 NDI1YML120C 1542 nt10.08□□□□□ -0.8
CIK1Q01649 YDR433WYDR433W 441 nt10.06□□□□□ -0.8
CIK1Q01649 IRC24YIR036C 792 nt10.06□□□□□ -0.8
CIK1Q01649 WSC2YNL283C 1512 nt10.06□□□□□ -0.8
CIK1Q01649 ERV46YAL042W 1248 nt10.05□□□□□ -0.8
CIK1Q01649 YIH1YCR059C 777 nt10.04□□□□□ -0.8
CIK1Q01649 MIC10YCL057C-A 294 nt10.04□□□□□ -0.8
CIK1Q01649 YAT1YAR035W 2064 nt10.03□□□□□ -0.8
CIK1Q01649 LPX1YOR084W 1164 nt10.02□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 SNG1YGR197C 1644 nt10.01□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 YFL067WYFL067W 528 nt10□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 YGR259CYGR259C 441 nt9.99□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 YLL053CYLL053C 459 nt9.99□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 ATF2YGR177C 1608 nt9.99□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 SOR2YDL246C 1074 nt9.98□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 SOR1YJR159W 1074 nt9.98□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 YKR040CYKR040C 504 nt9.97□□□□□ -0.81
CIK1Q01649 YCL074WYCL074W 927 nt9.96□□□□□ -0.82
CIK1Q01649 RNQ1YCL028W 1218 nt9.96□□□□□ -0.82
CIK1Q01649 MRPL8YJL063C 717 nt9.95□□□□□ -0.82
CIK1Q01649 MXR2YCL033C 507 nt9.95□□□□□ -0.82
CIK1Q01649 YCL042WYCL042W 360 nt9.94□□□□□ -0.82
CIK1Q01649 SPT20YOL148C 1815 nt9.91□□□□□ -0.82
CIK1Q01649 SPP1YPL138C 1062 nt9.91□□□□□ -0.82
CIK1Q01649 BNA2YJR078W 1362 nt9.88□□□□□ -0.83
CIK1Q01649 FTR1YER145C 1215 nt9.88□□□□□ -0.83
CIK1Q01649 DUS1YML080W 1272 nt9.87□□□□□ -0.83
CIK1Q01649 DDR2YOL052C-A 186 nt9.86□□□□□ -0.83
CIK1Q01649 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.85□□□□□ -0.83
CIK1Q01649 MIC12YBR262C 321 nt9.85□□□□□ -0.83
CIK1Q01649 AGP1YCL025C 1902 nt9.85□□□□□ -0.83
CIK1Q01649 RIM8YGL045W 1629 nt9.84□□□□□ -0.83
CIK1Q01649 TRM5YHR070W 1500 nt9.83□□□□□ -0.84
CIK1Q01649 RTG1YOL067C 534 nt9.83□□□□□ -0.84
CIK1Q01649 GAL1YBR020W 1587 nt9.83□□□□□ -0.84
CIK1Q01649 FRD1YEL047C 1413 nt9.82□□□□□ -0.84
CIK1Q01649 ANP1YEL036C 1503 nt9.82□□□□□ -0.84
CIK1Q01649 ADO1YJR105W 1023 nt9.79□□□□□ -0.84
CIK1Q01649 MET2YNL277W 1461 nt9.78□□□□□ -0.84
CIK1Q01649 YGL114WYGL114W 2178 nt9.76□□□□□ -0.85
CIK1Q01649 DIC1YLR348C 897 nt9.74□□□□□ -0.85
CIK1Q01649 MAE1YKL029C 2010 nt9.73□□□□□ -0.85
CIK1Q01649 INA1YLR413W 2028 nt9.73□□□□□ -0.85
CIK1Q01649 HHO1YPL127C 777 nt9.73□□□□□ -0.85
CIK1Q01649 RPC82YPR190C 1965 nt9.72□□□□□ -0.85
CIK1Q01649 AQY1YPR192W 918 nt9.72□□□□□ -0.85
CIK1Q01649 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.69□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.69□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 YGR201CYGR201C 678 nt9.67□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 STR3YGL184C 1398 nt9.66□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 GPI16YHR188C 1833 nt9.66□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 YLR235CYLR235C 399 nt9.66□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 SFP1YLR403W 2052 nt9.65□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 XDJ1YLR090W 1380 nt9.65□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 FEN2YCR028C 1539 nt9.65□□□□□ -0.86
CIK1Q01649 SPC25YER018C 666 nt9.64□□□□□ -0.87
CIK1Q01649 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.63□□□□□ -0.87
CIK1Q01649 STB1YNL309W 1263 nt9.63□□□□□ -0.87
CIK1Q01649 MUP1YGR055W 1725 nt9.62□□□□□ -0.87
CIK1Q01649 RTN2YDL204W 1182 nt9.62□□□□□ -0.87
CIK1Q01649 PTH1YHR189W 573 nt9.61□□□□□ -0.87
CIK1Q01649 HUA1YGR268C 597 nt9.6□□□□□ -0.87
CIK1Q01649 UBX6YJL048C 1191 nt9.6□□□□□ -0.87
CIK1Q01649 YIR016WYIR016W 798 nt9.58□□□□□ -0.88
CIK1Q01649 BSP1YPR171W 1731 nt9.58□□□□□ -0.88
CIK1Q01649 GDH3YAL062W 1374 nt9.57□□□□□ -0.88
CIK1Q01649 YKL030WYKL030W 606 nt9.55□□□□□ -0.88
CIK1Q01649 TIM23YNR017W 669 nt9.54□□□□□ -0.88
CIK1Q01649 ACO2YJL200C 2370 nt9.54□□□□□ -0.88
CIK1Q01649 AQY2YLL052C 450 nt9.53□□□□□ -0.88
CIK1Q01649 SSN3YPL042C 1668 nt9.51□□□□□ -0.89
CIK1Q01649 YLR179CYLR179C 606 nt9.5□□□□□ -0.89
CIK1Q01649 YDR094WYDR094W 336 nt9.49□□□□□ -0.89
CIK1Q01649 VPS60YDR486C 690 nt9.49□□□□□ -0.89
CIK1Q01649 DUT1YBR252W 444 nt9.49□□□□□ -0.89
CIK1Q01649 GOR1YNL274C 1053 nt9.47□□□□□ -0.89
CIK1Q01649 NPP1YCR026C 2229 nt9.47□□□□□ -0.89
CIK1Q01649 CCT4YDL143W 1587 nt9.46□□□□□ -0.89
CIK1Q01649 HOL1YNR055C 1761 nt9.46□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 TPO4YOR273C 1980 nt9.45□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 HIF1YLL022C 1158 nt9.44□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 UGA4YDL210W 1716 nt9.44□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 HMG2YLR450W 3138 nt9.44□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 AVT6YER119C 1347 nt9.43□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 ALG3YBL082C 1377 nt9.42□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 YPR064WYPR064W 420 nt9.42□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 SWC5YBR231C 912 nt9.42□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 ALD4YOR374W 1560 nt9.41□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 AHT1YHR093W 549 nt9.4□□□□□ -0.9
CIK1Q01649 YMR209CYMR209C 1374 nt9.35□□□□□ -0.91
CIK1Q01649 PLB1YMR008C 1995 nt9.34□□□□□ -0.91
CIK1Q01649 TAD3YLR316C 969 nt9.34□□□□□ -0.91
CIK1Q01649 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.33□□□□□ -0.92
CIK1Q01649 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.32□□□□□ -0.92
CIK1Q01649 PRM5YIL117C 957 nt9.32□□□□□ -0.92
CIK1Q01649 ARP6YLR085C 1317 nt9.31□□□□□ -0.92
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