Protein–RNA interactions for Protein: Q00723

PRP38, Pre-mRNA-splicing factor 38, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP38Q00723 SNG1YGR197C 1644 nt10.68□□□□□ -0.7
PRP38Q00723 YJL225CYJL225C 5277 nt10.68□□□□□ -0.7
PRP38Q00723 DDR2YOL052C-A 186 nt10.67□□□□□ -0.7
PRP38Q00723 YKL030WYKL030W 606 nt10.64□□□□□ -0.71
PRP38Q00723 TIM23YNR017W 669 nt10.64□□□□□ -0.71
PRP38Q00723 AQY1YPR192W 918 nt10.62□□□□□ -0.71
PRP38Q00723 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.61□□□□□ -0.71
PRP38Q00723 RAX1YOR301W 1308 nt10.6□□□□□ -0.71
PRP38Q00723 YLR179CYLR179C 606 nt10.6□□□□□ -0.71
PRP38Q00723 STB1YNL309W 1263 nt10.56□□□□□ -0.72
PRP38Q00723 ANP1YEL036C 1503 nt10.56□□□□□ -0.72
PRP38Q00723 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.55□□□□□ -0.72
PRP38Q00723 SPC25YER018C 666 nt10.53□□□□□ -0.72
PRP38Q00723 BOR1YNL275W 1731 nt10.52□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 CCA1YER168C 1641 nt10.51□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 BNA2YJR078W 1362 nt10.51□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 GPI16YHR188C 1833 nt10.5□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 FEN2YCR028C 1539 nt10.49□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 WSC2YNL283C 1512 nt10.49□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 AHT1YHR093W 549 nt10.48□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.48□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.48□□□□□ -0.73
PRP38Q00723 VPS60YDR486C 690 nt10.45□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 YPR064WYPR064W 420 nt10.45□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 CCT4YDL143W 1587 nt10.44□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 MIC12YBR262C 321 nt10.44□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 HSP60YLR259C 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 YDR094WYDR094W 336 nt10.42□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 FUR4YBR021W 1902 nt10.41□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.4□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 YIR016WYIR016W 798 nt10.4□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 UBX6YJL048C 1191 nt10.4□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 SWC5YBR231C 912 nt10.4□□□□□ -0.74
PRP38Q00723 GLK1YCL040W 1503 nt10.39□□□□□ -0.75
PRP38Q00723 ALG3YBL082C 1377 nt10.39□□□□□ -0.75
PRP38Q00723 TAD3YLR316C 969 nt10.38□□□□□ -0.75
PRP38Q00723 HHO1YPL127C 777 nt10.36□□□□□ -0.75
PRP38Q00723 AGP1YCL025C 1902 nt10.34□□□□□ -0.75
PRP38Q00723 DUS1YML080W 1272 nt10.3□□□□□ -0.76
PRP38Q00723 YGR201CYGR201C 678 nt10.28□□□□□ -0.76
PRP38Q00723 PRP4YPR178W 1398 nt10.25□□□□□ -0.77
PRP38Q00723 YFR018CYFR018C 1092 nt10.24□□□□□ -0.77
PRP38Q00723 BDH1YAL060W 1149 nt10.24□□□□□ -0.77
PRP38Q00723 YCL074WYCL074W 927 nt10.23□□□□□ -0.77
PRP38Q00723 YLR415CYLR415C 339 nt10.23□□□□□ -0.77
PRP38Q00723 XDJ1YLR090W 1380 nt10.23□□□□□ -0.77
PRP38Q00723 GDH3YAL062W 1374 nt10.18□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 RRT5YFR032C 870 nt10.18□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 DUT1YBR252W 444 nt10.18□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 AVT6YER119C 1347 nt10.17□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 Q0182Q0182 405 nt10.17□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 DPS1YLL018C 1674 nt10.17□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 YKR005CYKR005C 1578 nt10.17□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 BMT6YLR063W 1098 nt10.15□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 GOR1YNL274C 1053 nt10.15□□□□□ -0.78
PRP38Q00723 YSP3YOR003W 1437 nt10.14□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 AAC1YMR056C 930 nt10.13□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 SHM2YLR058C 1410 nt10.13□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 PEX25YPL112C 1185 nt10.12□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 STR3YGL184C 1398 nt10.12□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 ALG12YNR030W 1656 nt10.12□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 TIM17YJL143W 477 nt10.11□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.1□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 YGR259CYGR259C 441 nt10.1□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 PAU16YKL224C 372 nt10.1□□□□□ -0.79
PRP38Q00723 AQY2YLL052C 450 nt10.07□□□□□ -0.8
PRP38Q00723 PRE6YOL038W 765 nt10.05□□□□□ -0.8
PRP38Q00723 YNL115CYNL115C 1935 nt10.05□□□□□ -0.8
PRP38Q00723 UME6YDR207C 2511 nt10.04□□□□□ -0.8
PRP38Q00723 YFL066CYFL066C 1179 nt10.01□□□□□ -0.81
PRP38Q00723 NIT1YIL164C 600 nt10.01□□□□□ -0.81
PRP38Q00723 SNF1YDR477W 1902 nt10□□□□□ -0.81
PRP38Q00723 DAT1YML113W 747 nt10□□□□□ -0.81
PRP38Q00723 IRC24YIR036C 792 nt9.99□□□□□ -0.81
PRP38Q00723 VPS75YNL246W 795 nt9.98□□□□□ -0.81
PRP38Q00723 SGT2YOR007C 1041 nt9.98□□□□□ -0.81
PRP38Q00723 RTN2YDL204W 1182 nt9.96□□□□□ -0.82
PRP38Q00723 BIO5YNR056C 1686 nt9.94□□□□□ -0.82
PRP38Q00723 YCR102CYCR102C 1107 nt9.93□□□□□ -0.82
PRP38Q00723 NAT4YMR069W 858 nt9.92□□□□□ -0.82
PRP38Q00723 MCH5YOR306C 1566 nt9.91□□□□□ -0.82
PRP38Q00723 NBP35YGL091C 987 nt9.89□□□□□ -0.83
PRP38Q00723 NAR1YNL240C 1476 nt9.86□□□□□ -0.83
PRP38Q00723 PAU7YAR020C 168 nt9.85□□□□□ -0.83
PRP38Q00723 MIR1YJR077C 936 nt9.83□□□□□ -0.84
PRP38Q00723 THI74YDR438W 1113 nt9.82□□□□□ -0.84
PRP38Q00723 PLB1YMR008C 1995 nt9.82□□□□□ -0.84
PRP38Q00723 MSF1YPR047W 1410 nt9.81□□□□□ -0.84
PRP38Q00723 ARP6YLR085C 1317 nt9.81□□□□□ -0.84
PRP38Q00723 PBP1YGR178C 2169 nt9.78□□□□□ -0.84
PRP38Q00723 RPM1RPM1 483 nt9.76□□□□□ -0.85
PRP38Q00723 TIR3YIL011W 810 nt9.75□□□□□ -0.85
PRP38Q00723 CYT2YKL087C 675 nt9.75□□□□□ -0.85
PRP38Q00723 SHB17YKR043C 816 nt9.72□□□□□ -0.85
PRP38Q00723 SHH4YLR164W 507 nt9.72□□□□□ -0.85
PRP38Q00723 YDR010CYDR010C 333 nt9.71□□□□□ -0.86
PRP38Q00723 LSC2YGR244C 1284 nt9.71□□□□□ -0.86
PRP38Q00723 UBA4YHR111W 1323 nt9.7□□□□□ -0.86
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