Protein–RNA interactions for Protein: P53270

YGR117C, Uncharacterized protein YGR117C, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR117CP53270 CCT4YDL143W 1587 nt12.66□□□□□ -0.38
YGR117CP53270 DAT1YML113W 747 nt12.66□□□□□ -0.38
YGR117CP53270 RBG2YGR173W 1107 nt12.65□□□□□ -0.38
YGR117CP53270 TRM5YHR070W 1500 nt12.65□□□□□ -0.38
YGR117CP53270 STB1YNL309W 1263 nt12.64□□□□□ -0.39
YGR117CP53270 BIO4YNR057C 714 nt12.64□□□□□ -0.39
YGR117CP53270 YNL195CYNL195C 786 nt12.62□□□□□ -0.39
YGR117CP53270 SPC25YER018C 666 nt12.61□□□□□ -0.39
YGR117CP53270 YGL034CYGL034C 366 nt12.6□□□□□ -0.39
YGR117CP53270 SWC5YBR231C 912 nt12.59□□□□□ -0.39
YGR117CP53270 SIM1YIL123W 1431 nt12.59□□□□□ -0.39
YGR117CP53270 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.58□□□□□ -0.4
YGR117CP53270 PAU7YAR020C 168 nt12.56□□□□□ -0.4
YGR117CP53270 GPI16YHR188C 1833 nt12.55□□□□□ -0.4
YGR117CP53270 VPS60YDR486C 690 nt12.54□□□□□ -0.4
YGR117CP53270 NDI1YML120C 1542 nt12.53□□□□□ -0.4
YGR117CP53270 DDR2YOL052C-A 186 nt12.53□□□□□ -0.4
YGR117CP53270 YBR220CYBR220C 1683 nt12.51□□□□□ -0.41
YGR117CP53270 SPT8YLR055C 1809 nt12.51□□□□□ -0.41
YGR117CP53270 UBA4YHR111W 1323 nt12.5□□□□□ -0.41
YGR117CP53270 RRT12YCR045C 1476 nt12.5□□□□□ -0.41
YGR117CP53270 ALG3YBL082C 1377 nt12.48□□□□□ -0.41
YGR117CP53270 ATF2YGR177C 1608 nt12.47□□□□□ -0.41
YGR117CP53270 RBG1YAL036C 1110 nt12.46□□□□□ -0.41
YGR117CP53270 YSR3YKR053C 1215 nt12.45□□□□□ -0.42
YGR117CP53270 YFL067WYFL067W 528 nt12.44□□□□□ -0.42
YGR117CP53270 FEN2YCR028C 1539 nt12.42□□□□□ -0.42
YGR117CP53270 XYL2YLR070C 1071 nt12.42□□□□□ -0.42
YGR117CP53270 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.41□□□□□ -0.42
YGR117CP53270 SHB17YKR043C 816 nt12.41□□□□□ -0.42
YGR117CP53270 ERF2YLR246W 1080 nt12.36□□□□□ -0.43
YGR117CP53270 YMR226CYMR226C 804 nt12.36□□□□□ -0.43
YGR117CP53270 TIM17YJL143W 477 nt12.35□□□□□ -0.43
YGR117CP53270 SAM1YLR180W 1149 nt12.35□□□□□ -0.43
YGR117CP53270 ANP1YEL036C 1503 nt12.33□□□□□ -0.44
YGR117CP53270 YIR016WYIR016W 798 nt12.29□□□□□ -0.44
YGR117CP53270 YHL050CYHL050C 2094 nt12.29□□□□□ -0.44
YGR117CP53270 YDR010CYDR010C 333 nt12.28□□□□□ -0.44
YGR117CP53270 CRR1YLR213C 1269 nt12.27□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 RPM1RPM1 483 nt12.26□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 SSA4YER103W 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 SHM2YLR058C 1410 nt12.24□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 PHO89YBR296C 1725 nt12.23□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 SNG1YGR197C 1644 nt12.23□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 RAD51YER095W 1203 nt12.23□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 YCR087WYCR087W 516 nt12.22□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 AIM45YPR004C 1035 nt12.22□□□□□ -0.45
YGR117CP53270 RET2YFR051C 1641 nt12.19□□□□□ -0.46
YGR117CP53270 HEM12YDR047W 1089 nt12.19□□□□□ -0.46
YGR117CP53270 SGT2YOR007C 1041 nt12.16□□□□□ -0.46
YGR117CP53270 MIC10YCL057C-A 294 nt12.16□□□□□ -0.46
YGR117CP53270 YLR111WYLR111W 333 nt12.13□□□□□ -0.47
YGR117CP53270 XDJ1YLR090W 1380 nt12.13□□□□□ -0.47
YGR117CP53270 NIT1YIL164C 600 nt12.12□□□□□ -0.47
YGR117CP53270 MRP20YDR405W 792 nt12.1□□□□□ -0.47
YGR117CP53270 YNR029CYNR029C 1290 nt12.08□□□□□ -0.48
YGR117CP53270 GDH3YAL062W 1374 nt12.05□□□□□ -0.48
YGR117CP53270 COQ2YNR041C 1119 nt12.04□□□□□ -0.48
YGR117CP53270 LYS4YDR234W 2082 nt12.04□□□□□ -0.48
YGR117CP53270 STE4YOR212W 1272 nt12.01□□□□□ -0.49
YGR117CP53270 BNA2YJR078W 1362 nt11.97□□□□□ -0.49
YGR117CP53270 NCP1YHR042W 2076 nt11.96□□□□□ -0.49
YGR117CP53270 YLR349WYLR349W 507 nt11.96□□□□□ -0.49
YGR117CP53270 SEC11YIR022W 504 nt11.94□□□□□ -0.5
YGR117CP53270 SDH5YOL071W 489 nt11.94□□□□□ -0.5
YGR117CP53270 ADH7YCR105W 1086 nt11.91□□□□□ -0.5
YGR117CP53270 SFA1YDL168W 1161 nt11.9□□□□□ -0.5
YGR117CP53270 PAU15YIR041W 375 nt11.9□□□□□ -0.5
YGR117CP53270 MIC12YBR262C 321 nt11.89□□□□□ -0.51
YGR117CP53270 RPL4BYDR012W 1089 nt11.88□□□□□ -0.51
YGR117CP53270 RAD23YEL037C 1197 nt11.88□□□□□ -0.51
YGR117CP53270 RPL4AYBR031W 1089 nt11.88□□□□□ -0.51
YGR117CP53270 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.87□□□□□ -0.51
YGR117CP53270 FUN14YAL008W 597 nt11.85□□□□□ -0.51
YGR117CP53270 HHO1YPL127C 777 nt11.85□□□□□ -0.51
YGR117CP53270 YGR201CYGR201C 678 nt11.83□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.83□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 YLR279WYLR279W 390 nt11.83□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 AVT6YER119C 1347 nt11.83□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 CLB6YGR109C 1143 nt11.82□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.81□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 RPS14BYJL191W 417 nt11.81□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 CAB5YDR196C 726 nt11.8□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 YJL195CYJL195C 702 nt11.79□□□□□ -0.52
YGR117CP53270 YCR102CYCR102C 1107 nt11.77□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 RAX1YOR301W 1308 nt11.77□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 RIB3YDR487C 627 nt11.75□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 GOR1YNL274C 1053 nt11.75□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 PCH2YBR186W 1695 nt11.75□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 YGR012WYGR012W 1182 nt11.72□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 UTH1YKR042W 1098 nt11.71□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 BOP3YNL042W 1191 nt11.71□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 GPN2YOR262W 1044 nt11.71□□□□□ -0.53
YGR117CP53270 TSC10YBR265W 963 nt11.7□□□□□ -0.54
YGR117CP53270 BDF1YLR399C 2061 nt11.66□□□□□ -0.54
YGR117CP53270 ADH1YOL086C 1047 nt11.66□□□□□ -0.54
YGR117CP53270 GUT2YIL155C 1950 nt11.65□□□□□ -0.54
YGR117CP53270 SHH4YLR164W 507 nt11.64□□□□□ -0.55
YGR117CP53270 TOM6YOR045W 186 nt11.64□□□□□ -0.55
YGR117CP53270 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.63□□□□□ -0.55
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