Protein–RNA interactions for Protein: P53148

SPC105, Spindle pole body component SPC105, yeastyeast

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105P53148 NCP1YHR042W 2076 nt10.99□□□□□ -0.65
SPC105P53148 RPM1RPM1 483 nt10.98□□□□□ -0.65
SPC105P53148 GAL1YBR020W 1587 nt10.97□□□□□ -0.65
SPC105P53148 ERF2YLR246W 1080 nt10.95□□□□□ -0.66
SPC105P53148 BOP3YNL042W 1191 nt10.95□□□□□ -0.66
SPC105P53148 TRM5YHR070W 1500 nt10.94□□□□□ -0.66
SPC105P53148 YFR018CYFR018C 1092 nt10.91□□□□□ -0.66
SPC105P53148 YFL067WYFL067W 528 nt10.9□□□□□ -0.66
SPC105P53148 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.9□□□□□ -0.66
SPC105P53148 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.9□□□□□ -0.66
SPC105P53148 FRE6YLL051C 2139 nt10.9□□□□□ -0.67
SPC105P53148 DDR2YOL052C-A 186 nt10.89□□□□□ -0.67
SPC105P53148 ATF2YGR177C 1608 nt10.88□□□□□ -0.67
SPC105P53148 CRR1YLR213C 1269 nt10.88□□□□□ -0.67
SPC105P53148 STB1YNL309W 1263 nt10.88□□□□□ -0.67
SPC105P53148 SPC25YER018C 666 nt10.87□□□□□ -0.67
SPC105P53148 MCH5YOR306C 1566 nt10.86□□□□□ -0.67
SPC105P53148 GPI16YHR188C 1833 nt10.84□□□□□ -0.67
SPC105P53148 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.84□□□□□ -0.67
SPC105P53148 CCT4YDL143W 1587 nt10.83□□□□□ -0.68
SPC105P53148 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.82□□□□□ -0.68
SPC105P53148 RRT5YFR032C 870 nt10.82□□□□□ -0.68
SPC105P53148 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.81□□□□□ -0.68
SPC105P53148 BDH1YAL060W 1149 nt10.8□□□□□ -0.68
SPC105P53148 PAU16YKL224C 372 nt10.79□□□□□ -0.68
SPC105P53148 YLR415CYLR415C 339 nt10.79□□□□□ -0.68
SPC105P53148 LYS4YDR234W 2082 nt10.79□□□□□ -0.68
SPC105P53148 HEM12YDR047W 1089 nt10.78□□□□□ -0.68
SPC105P53148 PEX25YPL112C 1185 nt10.78□□□□□ -0.68
SPC105P53148 SWC5YBR231C 912 nt10.78□□□□□ -0.68
SPC105P53148 ANP1YEL036C 1503 nt10.77□□□□□ -0.69
SPC105P53148 YSP3YOR003W 1437 nt10.76□□□□□ -0.69
SPC105P53148 VPS60YDR486C 690 nt10.76□□□□□ -0.69
SPC105P53148 PRE6YOL038W 765 nt10.76□□□□□ -0.69
SPC105P53148 SNG1YGR197C 1644 nt10.76□□□□□ -0.69
SPC105P53148 FEN2YCR028C 1539 nt10.74□□□□□ -0.69
SPC105P53148 YFL066CYFL066C 1179 nt10.71□□□□□ -0.69
SPC105P53148 MIC10YCL057C-A 294 nt10.71□□□□□ -0.69
SPC105P53148 YNL115CYNL115C 1935 nt10.7□□□□□ -0.7
SPC105P53148 ALG12YNR030W 1656 nt10.7□□□□□ -0.7
SPC105P53148 YFL054CYFL054C 1941 nt10.7□□□□□ -0.7
SPC105P53148 ALG3YBL082C 1377 nt10.69□□□□□ -0.7
SPC105P53148 SPT8YLR055C 1809 nt10.68□□□□□ -0.7
SPC105P53148 YIR016WYIR016W 798 nt10.64□□□□□ -0.71
SPC105P53148 HSP60YLR259C 1719 nt10.62□□□□□ -0.71
SPC105P53148 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.61□□□□□ -0.71
SPC105P53148 VPS75YNL246W 795 nt10.61□□□□□ -0.71
SPC105P53148 BNA2YJR078W 1362 nt10.58□□□□□ -0.72
SPC105P53148 NAT4YMR069W 858 nt10.56□□□□□ -0.72
SPC105P53148 RAX1YOR301W 1308 nt10.55□□□□□ -0.72
SPC105P53148 GLK1YCL040W 1503 nt10.54□□□□□ -0.72
SPC105P53148 TIM17YJL143W 477 nt10.54□□□□□ -0.72
SPC105P53148 MIC12YBR262C 321 nt10.53□□□□□ -0.72
SPC105P53148 MIR1YJR077C 936 nt10.49□□□□□ -0.73
SPC105P53148 XDJ1YLR090W 1380 nt10.49□□□□□ -0.73
SPC105P53148 SHM2YLR058C 1410 nt10.47□□□□□ -0.73
SPC105P53148 THI74YDR438W 1113 nt10.46□□□□□ -0.73
SPC105P53148 PAU7YAR020C 168 nt10.46□□□□□ -0.73
SPC105P53148 MSF1YPR047W 1410 nt10.45□□□□□ -0.74
SPC105P53148 YGR201CYGR201C 678 nt10.45□□□□□ -0.74
SPC105P53148 HHO1YPL127C 777 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC105P53148 SWE1YJL187C 2460 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC105P53148 GDH3YAL062W 1374 nt10.41□□□□□ -0.74
SPC105P53148 SBA1YKL117W 651 nt10.41□□□□□ -0.74
SPC105P53148 NAR1YNL240C 1476 nt10.38□□□□□ -0.75
SPC105P53148 NIT1YIL164C 600 nt10.36□□□□□ -0.75
SPC105P53148 SGT2YOR007C 1041 nt10.36□□□□□ -0.75
SPC105P53148 DAT1YML113W 747 nt10.34□□□□□ -0.75
SPC105P53148 SHB17YKR043C 816 nt10.33□□□□□ -0.76
SPC105P53148 UBA4YHR111W 1323 nt10.33□□□□□ -0.76
SPC105P53148 AVT6YER119C 1347 nt10.32□□□□□ -0.76
SPC105P53148 CCA1YER168C 1641 nt10.31□□□□□ -0.76
SPC105P53148 GOR1YNL274C 1053 nt10.29□□□□□ -0.76
SPC105P53148 YSR3YKR053C 1215 nt10.28□□□□□ -0.76
SPC105P53148 YDR010CYDR010C 333 nt10.27□□□□□ -0.77
SPC105P53148 YGL034CYGL034C 366 nt10.26□□□□□ -0.77
SPC105P53148 AGP1YCL025C 1902 nt10.25□□□□□ -0.77
SPC105P53148 RET2YFR051C 1641 nt10.23□□□□□ -0.77
SPC105P53148 YCR087WYCR087W 516 nt10.21□□□□□ -0.77
SPC105P53148 YCR102CYCR102C 1107 nt10.21□□□□□ -0.77
SPC105P53148 AAC1YMR056C 930 nt10.19□□□□□ -0.78
SPC105P53148 NME1NME1 340 nt10.19□□□□□ -0.78
SPC105P53148 PHO89YBR296C 1725 nt10.19□□□□□ -0.78
SPC105P53148 XYL2YLR070C 1071 nt10.17□□□□□ -0.78
SPC105P53148 DUT1YBR252W 444 nt10.17□□□□□ -0.78
SPC105P53148 FUR4YBR021W 1902 nt10.17□□□□□ -0.78
SPC105P53148 BSP1YPR171W 1731 nt10.16□□□□□ -0.78
SPC105P53148 DUS1YML080W 1272 nt10.15□□□□□ -0.78
SPC105P53148 CMP2YML057W 1815 nt10.14□□□□□ -0.79
SPC105P53148 PRP4YPR178W 1398 nt10.14□□□□□ -0.79
SPC105P53148 NDI1YML120C 1542 nt10.12□□□□□ -0.79
SPC105P53148 GLR1YPL091W 1452 nt10.12□□□□□ -0.79
SPC105P53148 RBG1YAL036C 1110 nt10.11□□□□□ -0.79
SPC105P53148 AIM45YPR004C 1035 nt10.11□□□□□ -0.79
SPC105P53148 YMR244WYMR244W 1068 nt10.1□□□□□ -0.79
SPC105P53148 MRP20YDR405W 792 nt10.09□□□□□ -0.79
SPC105P53148 HSL7YBR133C 2484 nt10.09□□□□□ -0.79
SPC105P53148 PBP1YGR178C 2169 nt10.08□□□□□ -0.8
SPC105P53148 DPS1YLL018C 1674 nt10.08□□□□□ -0.8
SPC105P53148 BIO5YNR056C 1686 nt10.08□□□□□ -0.8
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