Protein–RNA interactions for Protein: P53146

USE1, Protein transport protein USE1, yeastyeast

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USE1P53146 DDR2YOL052C-A 186 nt10.78□□□□□ -0.68
USE1P53146 PRP4YPR178W 1398 nt10.77□□□□□ -0.68
USE1P53146 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.77□□□□□ -0.69
USE1P53146 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.75□□□□□ -0.69
USE1P53146 YEL076CYEL076C 651 nt10.75□□□□□ -0.69
USE1P53146 YLR464WYLR464W 651 nt10.75□□□□□ -0.69
USE1P53146 ANP1YEL036C 1503 nt10.74□□□□□ -0.69
USE1P53146 DPS1YLL018C 1674 nt10.73□□□□□ -0.69
USE1P53146 AGP1YCL025C 1902 nt10.7□□□□□ -0.7
USE1P53146 AAC1YMR056C 930 nt10.69□□□□□ -0.7
USE1P53146 MIC12YBR262C 321 nt10.69□□□□□ -0.7
USE1P53146 BNA2YJR078W 1362 nt10.65□□□□□ -0.7
USE1P53146 AQY1YPR192W 918 nt10.65□□□□□ -0.7
USE1P53146 YKR005CYKR005C 1578 nt10.65□□□□□ -0.71
USE1P53146 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.64□□□□□ -0.71
USE1P53146 PTH1YHR189W 573 nt10.64□□□□□ -0.71
USE1P53146 STB1YNL309W 1263 nt10.64□□□□□ -0.71
USE1P53146 SPC25YER018C 666 nt10.63□□□□□ -0.71
USE1P53146 FEN2YCR028C 1539 nt10.63□□□□□ -0.71
USE1P53146 WSC2YNL283C 1512 nt10.62□□□□□ -0.71
USE1P53146 SNF1YDR477W 1902 nt10.62□□□□□ -0.71
USE1P53146 BIO5YNR056C 1686 nt10.6□□□□□ -0.71
USE1P53146 NAR1YNL240C 1476 nt10.59□□□□□ -0.71
USE1P53146 TIM23YNR017W 669 nt10.58□□□□□ -0.72
USE1P53146 SPP1YPL138C 1062 nt10.58□□□□□ -0.72
USE1P53146 YCL074WYCL074W 927 nt10.57□□□□□ -0.72
USE1P53146 BMT6YLR063W 1098 nt10.57□□□□□ -0.72
USE1P53146 DUS1YML080W 1272 nt10.57□□□□□ -0.72
USE1P53146 YLR179CYLR179C 606 nt10.56□□□□□ -0.72
USE1P53146 HHO1YPL127C 777 nt10.56□□□□□ -0.72
USE1P53146 YIR016WYIR016W 798 nt10.55□□□□□ -0.72
USE1P53146 GPI16YHR188C 1833 nt10.55□□□□□ -0.72
USE1P53146 VPS60YDR486C 690 nt10.54□□□□□ -0.72
USE1P53146 YGR259CYGR259C 441 nt10.53□□□□□ -0.72
USE1P53146 YLR235CYLR235C 399 nt10.53□□□□□ -0.72
USE1P53146 XDJ1YLR090W 1380 nt10.52□□□□□ -0.73
USE1P53146 ALG3YBL082C 1377 nt10.52□□□□□ -0.73
USE1P53146 Q0182Q0182 405 nt10.51□□□□□ -0.73
USE1P53146 CCT4YDL143W 1587 nt10.5□□□□□ -0.73
USE1P53146 AHT1YHR093W 549 nt10.49□□□□□ -0.73
USE1P53146 PBP1YGR178C 2169 nt10.49□□□□□ -0.73
USE1P53146 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.49□□□□□ -0.73
USE1P53146 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.49□□□□□ -0.73
USE1P53146 DUT1YBR252W 444 nt10.48□□□□□ -0.73
USE1P53146 IRC24YIR036C 792 nt10.46□□□□□ -0.73
USE1P53146 STR3YGL184C 1398 nt10.44□□□□□ -0.74
USE1P53146 YGR201CYGR201C 678 nt10.44□□□□□ -0.74
USE1P53146 CYT2YKL087C 675 nt10.41□□□□□ -0.74
USE1P53146 SWC5YBR231C 912 nt10.41□□□□□ -0.74
USE1P53146 YKL030WYKL030W 606 nt10.39□□□□□ -0.75
USE1P53146 YPR064WYPR064W 420 nt10.35□□□□□ -0.75
USE1P53146 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.33□□□□□ -0.76
USE1P53146 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.33□□□□□ -0.76
USE1P53146 AQY2YLL052C 450 nt10.32□□□□□ -0.76
USE1P53146 AVT6YER119C 1347 nt10.32□□□□□ -0.76
USE1P53146 TAD3YLR316C 969 nt10.29□□□□□ -0.76
USE1P53146 GDH3YAL062W 1374 nt10.28□□□□□ -0.76
USE1P53146 GOR1YNL274C 1053 nt10.28□□□□□ -0.76
USE1P53146 MOT3YMR070W 1473 nt10.28□□□□□ -0.76
USE1P53146 BDH1YAL060W 1149 nt10.24□□□□□ -0.77
USE1P53146 RTN2YDL204W 1182 nt10.23□□□□□ -0.77
USE1P53146 YAT1YAR035W 2064 nt10.22□□□□□ -0.77
USE1P53146 SHM2YLR058C 1410 nt10.2□□□□□ -0.78
USE1P53146 CMP2YML057W 1815 nt10.17□□□□□ -0.78
USE1P53146 YLR415CYLR415C 339 nt10.15□□□□□ -0.78
USE1P53146 RTG1YOL067C 534 nt10.13□□□□□ -0.79
USE1P53146 NIT1YIL164C 600 nt10.12□□□□□ -0.79
USE1P53146 DAT1YML113W 747 nt10.11□□□□□ -0.79
USE1P53146 PLB1YMR008C 1995 nt10.1□□□□□ -0.79
USE1P53146 TIM17YJL143W 477 nt10.09□□□□□ -0.79
USE1P53146 YSP3YOR003W 1437 nt10.08□□□□□ -0.8
USE1P53146 NBP35YGL091C 987 nt10.08□□□□□ -0.8
USE1P53146 HSL7YBR133C 2484 nt10.07□□□□□ -0.8
USE1P53146 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.06□□□□□ -0.8
USE1P53146 ARP6YLR085C 1317 nt10.06□□□□□ -0.8
USE1P53146 PRM5YIL117C 957 nt10.05□□□□□ -0.8
USE1P53146 HIF1YLL022C 1158 nt10.05□□□□□ -0.8
USE1P53146 NDI1YML120C 1542 nt10.04□□□□□ -0.8
USE1P53146 SGT2YOR007C 1041 nt10.02□□□□□ -0.81
USE1P53146 YCR102CYCR102C 1107 nt10.01□□□□□ -0.81
USE1P53146 ALD4YOR374W 1560 nt9.98□□□□□ -0.81
USE1P53146 RPC82YPR190C 1965 nt9.97□□□□□ -0.81
USE1P53146 SPT20YOL148C 1815 nt9.96□□□□□ -0.82
USE1P53146 YNL115CYNL115C 1935 nt9.95□□□□□ -0.82
USE1P53146 UTR1YJR049C 1593 nt9.94□□□□□ -0.82
USE1P53146 INA1YLR413W 2028 nt9.9□□□□□ -0.82
USE1P53146 SHH4YLR164W 507 nt9.88□□□□□ -0.83
USE1P53146 HUA1YGR268C 597 nt9.87□□□□□ -0.83
USE1P53146 PEX25YPL112C 1185 nt9.87□□□□□ -0.83
USE1P53146 GAP1YKR039W 1809 nt9.85□□□□□ -0.83
USE1P53146 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.85□□□□□ -0.83
USE1P53146 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.85□□□□□ -0.83
USE1P53146 PRO1YDR300C 1287 nt9.83□□□□□ -0.84
USE1P53146 YFL066CYFL066C 1179 nt9.83□□□□□ -0.84
USE1P53146 TIR3YIL011W 810 nt9.83□□□□□ -0.84
USE1P53146 LSC2YGR244C 1284 nt9.82□□□□□ -0.84
USE1P53146 VPS75YNL246W 795 nt9.81□□□□□ -0.84
USE1P53146 ZRT3YKL175W 1512 nt9.78□□□□□ -0.84
USE1P53146 POM34YLR018C 900 nt9.77□□□□□ -0.85
USE1P53146 SAM35YHR083W 990 nt9.75□□□□□ -0.85
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