Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 STB1YNL309W 1263 nt11.17□□□□□ -0.62
UFE1P41834 SPC25YER018C 666 nt11.16□□□□□ -0.62
UFE1P41834 YFL067WYFL067W 528 nt11.15□□□□□ -0.62
UFE1P41834 ATF2YGR177C 1608 nt11.14□□□□□ -0.63
UFE1P41834 BDH1YAL060W 1149 nt11.14□□□□□ -0.63
UFE1P41834 PEX25YPL112C 1185 nt11.14□□□□□ -0.63
UFE1P41834 DDR2YOL052C-A 186 nt11.13□□□□□ -0.63
UFE1P41834 CCT4YDL143W 1587 nt11.12□□□□□ -0.63
UFE1P41834 CRR1YLR213C 1269 nt11.12□□□□□ -0.63
UFE1P41834 GPI16YHR188C 1833 nt11.12□□□□□ -0.63
UFE1P41834 YSP3YOR003W 1437 nt11.11□□□□□ -0.63
UFE1P41834 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.11□□□□□ -0.63
UFE1P41834 YLR415CYLR415C 339 nt11.11□□□□□ -0.63
UFE1P41834 GUT2YIL155C 1950 nt11.1□□□□□ -0.63
UFE1P41834 NCP1YHR042W 2076 nt11.09□□□□□ -0.63
UFE1P41834 YFL066CYFL066C 1179 nt11.09□□□□□ -0.63
UFE1P41834 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.07□□□□□ -0.64
UFE1P41834 YNL115CYNL115C 1935 nt11.05□□□□□ -0.64
UFE1P41834 VPS60YDR486C 690 nt11.05□□□□□ -0.64
UFE1P41834 SWC5YBR231C 912 nt11.05□□□□□ -0.64
UFE1P41834 BOP3YNL042W 1191 nt11.03□□□□□ -0.64
UFE1P41834 ANP1YEL036C 1503 nt11.03□□□□□ -0.64
UFE1P41834 FEN2YCR028C 1539 nt11.01□□□□□ -0.65
UFE1P41834 LYS4YDR234W 2082 nt11□□□□□ -0.65
UFE1P41834 SNG1YGR197C 1644 nt10.99□□□□□ -0.65
UFE1P41834 RTF1YGL244W 1677 nt10.99□□□□□ -0.65
UFE1P41834 HEM12YDR047W 1089 nt10.99□□□□□ -0.65
UFE1P41834 ALG3YBL082C 1377 nt10.99□□□□□ -0.65
UFE1P41834 SBA1YKL117W 651 nt10.95□□□□□ -0.66
UFE1P41834 NAT4YMR069W 858 nt10.95□□□□□ -0.66
UFE1P41834 VPS75YNL246W 795 nt10.95□□□□□ -0.66
UFE1P41834 MIC10YCL057C-A 294 nt10.94□□□□□ -0.66
UFE1P41834 PIB2YGL023C 1908 nt10.94□□□□□ -0.66
UFE1P41834 YJL225CYJL225C 5277 nt10.93□□□□□ -0.66
UFE1P41834 SPT8YLR055C 1809 nt10.92□□□□□ -0.66
UFE1P41834 GLK1YCL040W 1503 nt10.91□□□□□ -0.66
UFE1P41834 YIR016WYIR016W 798 nt10.9□□□□□ -0.66
UFE1P41834 MIR1YJR077C 936 nt10.87□□□□□ -0.67
UFE1P41834 MSF1YPR047W 1410 nt10.85□□□□□ -0.67
UFE1P41834 THI74YDR438W 1113 nt10.84□□□□□ -0.67
UFE1P41834 TIM17YJL143W 477 nt10.82□□□□□ -0.68
UFE1P41834 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.81□□□□□ -0.68
UFE1P41834 PTK1YKL198C 1989 nt10.8□□□□□ -0.68
UFE1P41834 BNA2YJR078W 1362 nt10.78□□□□□ -0.68
UFE1P41834 MIC12YBR262C 321 nt10.77□□□□□ -0.69
UFE1P41834 PAU7YAR020C 168 nt10.76□□□□□ -0.69
UFE1P41834 SHM2YLR058C 1410 nt10.75□□□□□ -0.69
UFE1P41834 RAX1YOR301W 1308 nt10.74□□□□□ -0.69
UFE1P41834 XDJ1YLR090W 1380 nt10.74□□□□□ -0.69
UFE1P41834 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.72□□□□□ -0.69
UFE1P41834 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.72□□□□□ -0.69
UFE1P41834 DAT1YML113W 747 nt10.71□□□□□ -0.69
UFE1P41834 UBA4YHR111W 1323 nt10.67□□□□□ -0.7
UFE1P41834 YGR201CYGR201C 678 nt10.67□□□□□ -0.7
UFE1P41834 SHB17YKR043C 816 nt10.67□□□□□ -0.7
UFE1P41834 GDH3YAL062W 1374 nt10.65□□□□□ -0.7
UFE1P41834 NIT1YIL164C 600 nt10.65□□□□□ -0.7
UFE1P41834 SGT2YOR007C 1041 nt10.65□□□□□ -0.7
UFE1P41834 YFL054CYFL054C 1941 nt10.64□□□□□ -0.71
UFE1P41834 HHO1YPL127C 777 nt10.64□□□□□ -0.71
UFE1P41834 YGL034CYGL034C 366 nt10.63□□□□□ -0.71
UFE1P41834 YDR010CYDR010C 333 nt10.61□□□□□ -0.71
UFE1P41834 YSR3YKR053C 1215 nt10.61□□□□□ -0.71
UFE1P41834 UME6YDR207C 2511 nt10.57□□□□□ -0.72
UFE1P41834 YMR244WYMR244W 1068 nt10.57□□□□□ -0.72
UFE1P41834 RET2YFR051C 1641 nt10.55□□□□□ -0.72
UFE1P41834 GLR1YPL091W 1452 nt10.54□□□□□ -0.72
UFE1P41834 AVT6YER119C 1347 nt10.54□□□□□ -0.72
UFE1P41834 YCR087WYCR087W 516 nt10.53□□□□□ -0.72
UFE1P41834 XYL2YLR070C 1071 nt10.52□□□□□ -0.73
UFE1P41834 PHO89YBR296C 1725 nt10.51□□□□□ -0.73
UFE1P41834 GOR1YNL274C 1053 nt10.5□□□□□ -0.73
UFE1P41834 NDI1YML120C 1542 nt10.49□□□□□ -0.73
UFE1P41834 CCA1YER168C 1641 nt10.48□□□□□ -0.73
UFE1P41834 RBG1YAL036C 1110 nt10.47□□□□□ -0.73
UFE1P41834 AIM45YPR004C 1035 nt10.46□□□□□ -0.73
UFE1P41834 AGP1YCL025C 1902 nt10.46□□□□□ -0.74
UFE1P41834 YCR102CYCR102C 1107 nt10.45□□□□□ -0.74
UFE1P41834 SWE1YJL187C 2460 nt10.44□□□□□ -0.74
UFE1P41834 DUT1YBR252W 444 nt10.41□□□□□ -0.74
UFE1P41834 MRP20YDR405W 792 nt10.4□□□□□ -0.74
UFE1P41834 RBG2YGR173W 1107 nt10.38□□□□□ -0.75
UFE1P41834 COQ2YNR041C 1119 nt10.37□□□□□ -0.75
UFE1P41834 SFA1YDL168W 1161 nt10.36□□□□□ -0.75
UFE1P41834 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.32□□□□□ -0.76
UFE1P41834 YMR226CYMR226C 804 nt10.31□□□□□ -0.76
UFE1P41834 NBP35YGL091C 987 nt10.3□□□□□ -0.76
UFE1P41834 TIR3YIL011W 810 nt10.29□□□□□ -0.76
UFE1P41834 DUS1YML080W 1272 nt10.29□□□□□ -0.76
UFE1P41834 RPL4BYDR012W 1089 nt10.28□□□□□ -0.76
UFE1P41834 RPL4AYBR031W 1089 nt10.28□□□□□ -0.76
UFE1P41834 CLB6YGR109C 1143 nt10.24□□□□□ -0.77
UFE1P41834 SHH4YLR164W 507 nt10.24□□□□□ -0.77
UFE1P41834 STR3YGL184C 1398 nt10.24□□□□□ -0.77
UFE1P41834 YCL074WYCL074W 927 nt10.22□□□□□ -0.77
UFE1P41834 RPS14BYJL191W 417 nt10.21□□□□□ -0.77
UFE1P41834 AQY2YLL052C 450 nt10.21□□□□□ -0.77
UFE1P41834 YLR111WYLR111W 333 nt10.21□□□□□ -0.77
UFE1P41834 LSC2YGR244C 1284 nt10.19□□□□□ -0.78
UFE1P41834 UTH1YKR042W 1098 nt10.19□□□□□ -0.78
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