Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

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Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 MIC10YCL057C-A 294 nt15.93■□□□□ 0.14
SSM4P40318 ERF2YLR246W 1080 nt15.9■□□□□ 0.14
SSM4P40318 STB1YNL309W 1263 nt15.87■□□□□ 0.13
SSM4P40318 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt15.86■□□□□ 0.13
SSM4P40318 DDR2YOL052C-A 186 nt15.84■□□□□ 0.13
SSM4P40318 AQY1YPR192W 918 nt15.84■□□□□ 0.13
SSM4P40318 PTK1YKL198C 1989 nt15.83■□□□□ 0.13
SSM4P40318 SNG1YGR197C 1644 nt15.82■□□□□ 0.12
SSM4P40318 PAU16YKL224C 372 nt15.8■□□□□ 0.12
SSM4P40318 BDH1YAL060W 1149 nt15.8■□□□□ 0.12
SSM4P40318 ALG3YBL082C 1377 nt15.79■□□□□ 0.12
SSM4P40318 VPS60YDR486C 690 nt15.79■□□□□ 0.12
SSM4P40318 SPC25YER018C 666 nt15.79■□□□□ 0.12
SSM4P40318 YFL066CYFL066C 1179 nt15.79■□□□□ 0.12
SSM4P40318 CCT4YDL143W 1587 nt15.77■□□□□ 0.12
SSM4P40318 YFL067WYFL067W 528 nt15.77■□□□□ 0.12
SSM4P40318 YFR018CYFR018C 1092 nt15.76■□□□□ 0.11
SSM4P40318 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt15.75■□□□□ 0.11
SSM4P40318 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.75■□□□□ 0.11
SSM4P40318 HEM12YDR047W 1089 nt15.74■□□□□ 0.11
SSM4P40318 ANP1YEL036C 1503 nt15.72■□□□□ 0.11
SSM4P40318 GPI16YHR188C 1833 nt15.7■□□□□ 0.1
SSM4P40318 YSP3YOR003W 1437 nt15.7■□□□□ 0.1
SSM4P40318 SWC5YBR231C 912 nt15.69■□□□□ 0.1
SSM4P40318 FEN2YCR028C 1539 nt15.69■□□□□ 0.1
SSM4P40318 PEX25YPL112C 1185 nt15.67■□□□□ 0.1
SSM4P40318 YNL115CYNL115C 1935 nt15.65■□□□□ 0.1
SSM4P40318 YLR415CYLR415C 339 nt15.63■□□□□ 0.09
SSM4P40318 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt15.58■□□□□ 0.08
SSM4P40318 YFL054CYFL054C 1941 nt15.58■□□□□ 0.08
SSM4P40318 RRT5YFR032C 870 nt15.53■□□□□ 0.08
SSM4P40318 YIR016WYIR016W 798 nt15.53■□□□□ 0.08
SSM4P40318 SPT8YLR055C 1809 nt15.43■□□□□ 0.06
SSM4P40318 MIC12YBR262C 321 nt15.37■□□□□ 0.05
SSM4P40318 RAX1YOR301W 1308 nt15.35■□□□□ 0.05
SSM4P40318 BNA2YJR078W 1362 nt15.35■□□□□ 0.05
SSM4P40318 XDJ1YLR090W 1380 nt15.35■□□□□ 0.05
SSM4P40318 SHM2YLR058C 1410 nt15.33■□□□□ 0.05
SSM4P40318 MIR1YJR077C 936 nt15.31■□□□□ 0.04
SSM4P40318 SBA1YKL117W 651 nt15.29■□□□□ 0.04
SSM4P40318 VPS75YNL246W 795 nt15.29■□□□□ 0.04
SSM4P40318 CCA1YER168C 1641 nt15.28■□□□□ 0.04
SSM4P40318 SWE1YJL187C 2460 nt15.27■□□□□ 0.03
SSM4P40318 AGP1YCL025C 1902 nt15.26■□□□□ 0.03
SSM4P40318 TIM17YJL143W 477 nt15.25■□□□□ 0.03
SSM4P40318 DUT1YBR252W 444 nt15.24■□□□□ 0.03
SSM4P40318 NIT1YIL164C 600 nt15.22■□□□□ 0.03
SSM4P40318 SGT2YOR007C 1041 nt15.22■□□□□ 0.03
SSM4P40318 HHO1YPL127C 777 nt15.2■□□□□ 0.02
SSM4P40318 GDH3YAL062W 1374 nt15.2■□□□□ 0.02
SSM4P40318 NAT4YMR069W 858 nt15.18■□□□□ 0.02
SSM4P40318 GLK1YCL040W 1503 nt15.18■□□□□ 0.02
SSM4P40318 THI74YDR438W 1113 nt15.16■□□□□ 0.02
SSM4P40318 MSF1YPR047W 1410 nt15.13■□□□□ 0.01
SSM4P40318 AVT6YER119C 1347 nt15.11■□□□□ 0.01
SSM4P40318 SHB17YKR043C 816 nt15.11■□□□□ 0.01
SSM4P40318 YGR201CYGR201C 678 nt15.1■□□□□ 0.01
SSM4P40318 PAU7YAR020C 168 nt15.1■□□□□ 0.01
SSM4P40318 DAT1YML113W 747 nt15.08■□□□□ 0
SSM4P40318 YDR010CYDR010C 333 nt15.06■□□□□ 0
SSM4P40318 UBA4YHR111W 1323 nt15.01□□□□□ -0.01
SSM4P40318 GOR1YNL274C 1053 nt14.92□□□□□ -0.02
SSM4P40318 XYL2YLR070C 1071 nt14.92□□□□□ -0.02
SSM4P40318 DUS1YML080W 1272 nt14.92□□□□□ -0.02
SSM4P40318 YGL034CYGL034C 366 nt14.91□□□□□ -0.02
SSM4P40318 YSR3YKR053C 1215 nt14.91□□□□□ -0.02
SSM4P40318 PHO89YBR296C 1725 nt14.86□□□□□ -0.03
SSM4P40318 RDN18-1RDN18-1 1800 nt14.86□□□□□ -0.03
SSM4P40318 RDN18-2RDN18-2 1800 nt14.86□□□□□ -0.03
SSM4P40318 SHH4YLR164W 507 nt14.83□□□□□ -0.04
SSM4P40318 PAC11YDR488C 1602 nt14.82□□□□□ -0.04
SSM4P40318 RET2YFR051C 1641 nt14.82□□□□□ -0.04
SSM4P40318 AQY2YLL052C 450 nt14.8□□□□□ -0.04
SSM4P40318 SFA1YDL168W 1161 nt14.79□□□□□ -0.04
SSM4P40318 RBG1YAL036C 1110 nt14.77□□□□□ -0.04
SSM4P40318 STR3YGL184C 1398 nt14.77□□□□□ -0.05
SSM4P40318 FUR4YBR021W 1902 nt14.76□□□□□ -0.05
SSM4P40318 YCR102CYCR102C 1107 nt14.75□□□□□ -0.05
SSM4P40318 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt14.72□□□□□ -0.05
SSM4P40318 COQ2YNR041C 1119 nt14.72□□□□□ -0.05
SSM4P40318 NBP35YGL091C 987 nt14.7□□□□□ -0.06
SSM4P40318 YCL074WYCL074W 927 nt14.68□□□□□ -0.06
SSM4P40318 NDI1YML120C 1542 nt14.68□□□□□ -0.06
SSM4P40318 YMR244WYMR244W 1068 nt14.66□□□□□ -0.06
SSM4P40318 AIM45YPR004C 1035 nt14.65□□□□□ -0.06
SSM4P40318 GLR1YPL091W 1452 nt14.58□□□□□ -0.08
SSM4P40318 TOM6YOR045W 186 nt14.58□□□□□ -0.08
SSM4P40318 YCR087WYCR087W 516 nt14.56□□□□□ -0.08
SSM4P40318 MRP20YDR405W 792 nt14.55□□□□□ -0.08
SSM4P40318 TIR3YIL011W 810 nt14.54□□□□□ -0.08
SSM4P40318 PEX2YJL210W 816 nt14.52□□□□□ -0.08
SSM4P40318 PRO1YDR300C 1287 nt14.51□□□□□ -0.09
SSM4P40318 HSP60YLR259C 1719 nt14.5□□□□□ -0.09
SSM4P40318 POM34YLR018C 900 nt14.47□□□□□ -0.09
SSM4P40318 YKR005CYKR005C 1578 nt14.43□□□□□ -0.1
SSM4P40318 PLB1YMR008C 1995 nt14.4□□□□□ -0.1
SSM4P40318 ATG15YCR068W 1563 nt14.39□□□□□ -0.11
SSM4P40318 RPS14BYJL191W 417 nt14.39□□□□□ -0.11
SSM4P40318 HIP1YGR191W 1812 nt14.38□□□□□ -0.11
SSM4P40318 CAB5YDR196C 726 nt14.38□□□□□ -0.11
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