Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YLR415CYLR415C 339 nt14.35□□□□□ -0.11
YRF1-2P40105 VPS75YNL246W 795 nt14.33□□□□□ -0.11
YRF1-2P40105 BDH1YAL060W 1149 nt14.33□□□□□ -0.12
YRF1-2P40105 FTR1YER145C 1215 nt14.31□□□□□ -0.12
YRF1-2P40105 AQY1YPR192W 918 nt14.27□□□□□ -0.12
YRF1-2P40105 TRM5YHR070W 1500 nt14.23□□□□□ -0.13
YRF1-2P40105 YHL050CYHL050C 2094 nt14.22□□□□□ -0.13
YRF1-2P40105 GAL1YBR020W 1587 nt14.22□□□□□ -0.13
YRF1-2P40105 SWC5YBR231C 912 nt14.2□□□□□ -0.14
YRF1-2P40105 SIM1YIL123W 1431 nt14.19□□□□□ -0.14
YRF1-2P40105 NDI1YML120C 1542 nt14.17□□□□□ -0.14
YRF1-2P40105 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt14.16□□□□□ -0.14
YRF1-2P40105 ATF2YGR177C 1608 nt14.15□□□□□ -0.14
YRF1-2P40105 RAD51YER095W 1203 nt14.11□□□□□ -0.15
YRF1-2P40105 CCT4YDL143W 1587 nt14.11□□□□□ -0.15
YRF1-2P40105 DAT1YML113W 747 nt14.1□□□□□ -0.15
YRF1-2P40105 STB1YNL309W 1263 nt14.09□□□□□ -0.15
YRF1-2P40105 ALG3YBL082C 1377 nt14.07□□□□□ -0.16
YRF1-2P40105 SPC25YER018C 666 nt14.07□□□□□ -0.16
YRF1-2P40105 GPI16YHR188C 1833 nt14.06□□□□□ -0.16
YRF1-2P40105 PAU7YAR020C 168 nt14.05□□□□□ -0.16
YRF1-2P40105 VPS60YDR486C 690 nt14.04□□□□□ -0.16
YRF1-2P40105 CRR1YLR213C 1269 nt14.04□□□□□ -0.16
YRF1-2P40105 YGL034CYGL034C 366 nt14.01□□□□□ -0.17
YRF1-2P40105 RBG1YAL036C 1110 nt14.01□□□□□ -0.17
YRF1-2P40105 DDR2YOL052C-A 186 nt14.01□□□□□ -0.17
YRF1-2P40105 SPT8YLR055C 1809 nt14.01□□□□□ -0.17
YRF1-2P40105 ERF2YLR246W 1080 nt14.01□□□□□ -0.17
YRF1-2P40105 UBA4YHR111W 1323 nt13.99□□□□□ -0.17
YRF1-2P40105 SHB17YKR043C 816 nt13.98□□□□□ -0.17
YRF1-2P40105 SAM1YLR180W 1149 nt13.95□□□□□ -0.18
YRF1-2P40105 RPM1RPM1 483 nt13.93□□□□□ -0.18
YRF1-2P40105 YFL067WYFL067W 528 nt13.91□□□□□ -0.18
YRF1-2P40105 TIM17YJL143W 477 nt13.91□□□□□ -0.18
YRF1-2P40105 MIC10YCL057C-A 294 nt13.91□□□□□ -0.18
YRF1-2P40105 BDF1YLR399C 2061 nt13.88□□□□□ -0.19
YRF1-2P40105 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.88□□□□□ -0.19
YRF1-2P40105 XYL2YLR070C 1071 nt13.87□□□□□ -0.19
YRF1-2P40105 ANP1YEL036C 1503 nt13.87□□□□□ -0.19
YRF1-2P40105 AIM45YPR004C 1035 nt13.83□□□□□ -0.2
YRF1-2P40105 TAT1YBR069C 1860 nt13.83□□□□□ -0.2
YRF1-2P40105 FEN2YCR028C 1539 nt13.81□□□□□ -0.2
YRF1-2P40105 SNG1YGR197C 1644 nt13.81□□□□□ -0.2
YRF1-2P40105 SEC11YIR022W 504 nt13.81□□□□□ -0.2
YRF1-2P40105 ADH7YCR105W 1086 nt13.79□□□□□ -0.2
YRF1-2P40105 YDR010CYDR010C 333 nt13.79□□□□□ -0.2
YRF1-2P40105 SGT2YOR007C 1041 nt13.78□□□□□ -0.2
YRF1-2P40105 YSR3YKR053C 1215 nt13.77□□□□□ -0.21
YRF1-2P40105 YNR029CYNR029C 1290 nt13.76□□□□□ -0.21
YRF1-2P40105 RET2YFR051C 1641 nt13.74□□□□□ -0.21
YRF1-2P40105 YLR111WYLR111W 333 nt13.73□□□□□ -0.21
YRF1-2P40105 PCH2YBR186W 1695 nt13.71□□□□□ -0.21
YRF1-2P40105 YCR087WYCR087W 516 nt13.71□□□□□ -0.21
YRF1-2P40105 HEM12YDR047W 1089 nt13.71□□□□□ -0.21
YRF1-2P40105 SDH5YOL071W 489 nt13.71□□□□□ -0.21
YRF1-2P40105 YLR349WYLR349W 507 nt13.69□□□□□ -0.22
YRF1-2P40105 SHM2YLR058C 1410 nt13.68□□□□□ -0.22
YRF1-2P40105 YMR226CYMR226C 804 nt13.68□□□□□ -0.22
YRF1-2P40105 PHO89YBR296C 1725 nt13.67□□□□□ -0.22
YRF1-2P40105 YIR016WYIR016W 798 nt13.66□□□□□ -0.22
YRF1-2P40105 LYS4YDR234W 2082 nt13.66□□□□□ -0.22
YRF1-2P40105 NCP1YHR042W 2076 nt13.62□□□□□ -0.23
YRF1-2P40105 XDJ1YLR090W 1380 nt13.62□□□□□ -0.23
YRF1-2P40105 NIT1YIL164C 600 nt13.59□□□□□ -0.23
YRF1-2P40105 STE4YOR212W 1272 nt13.58□□□□□ -0.24
YRF1-2P40105 GUT2YIL155C 1950 nt13.56□□□□□ -0.24
YRF1-2P40105 YLR279WYLR279W 390 nt13.55□□□□□ -0.24
YRF1-2P40105 BOP3YNL042W 1191 nt13.54□□□□□ -0.24
YRF1-2P40105 PAU15YIR041W 375 nt13.53□□□□□ -0.24
YRF1-2P40105 RTF1YGL244W 1677 nt13.53□□□□□ -0.24
YRF1-2P40105 COQ2YNR041C 1119 nt13.51□□□□□ -0.25
YRF1-2P40105 CAB5YDR196C 726 nt13.49□□□□□ -0.25
YRF1-2P40105 MIC12YBR262C 321 nt13.45□□□□□ -0.26
YRF1-2P40105 BNA2YJR078W 1362 nt13.45□□□□□ -0.26
YRF1-2P40105 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.44□□□□□ -0.26
YRF1-2P40105 PIB2YGL023C 1908 nt13.42□□□□□ -0.26
YRF1-2P40105 MRP20YDR405W 792 nt13.4□□□□□ -0.26
YRF1-2P40105 YGR201CYGR201C 678 nt13.4□□□□□ -0.26
YRF1-2P40105 RPS14BYJL191W 417 nt13.4□□□□□ -0.26
YRF1-2P40105 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.4□□□□□ -0.26
YRF1-2P40105 GDH3YAL062W 1374 nt13.39□□□□□ -0.27
YRF1-2P40105 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt13.31□□□□□ -0.28
YRF1-2P40105 AVT6YER119C 1347 nt13.31□□□□□ -0.28
YRF1-2P40105 SFA1YDL168W 1161 nt13.29□□□□□ -0.28
YRF1-2P40105 RPL4BYDR012W 1089 nt13.29□□□□□ -0.28
YRF1-2P40105 FUN14YAL008W 597 nt13.29□□□□□ -0.28
YRF1-2P40105 RPL4AYBR031W 1089 nt13.29□□□□□ -0.28
YRF1-2P40105 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt13.28□□□□□ -0.28
YRF1-2P40105 RAD23YEL037C 1197 nt13.28□□□□□ -0.28
YRF1-2P40105 HHO1YPL127C 777 nt13.27□□□□□ -0.29
YRF1-2P40105 YGR012WYGR012W 1182 nt13.23□□□□□ -0.29
YRF1-2P40105 YFL054CYFL054C 1941 nt13.22□□□□□ -0.29
YRF1-2P40105 PTK1YKL198C 1989 nt13.22□□□□□ -0.29
YRF1-2P40105 AGP1YCL025C 1902 nt13.2□□□□□ -0.3
YRF1-2P40105 RAX1YOR301W 1308 nt13.16□□□□□ -0.3
YRF1-2P40105 DUT1YBR252W 444 nt13.15□□□□□ -0.3
YRF1-2P40105 TSC10YBR265W 963 nt13.15□□□□□ -0.31
YRF1-2P40105 CCA1YER168C 1641 nt13.13□□□□□ -0.31
YRF1-2P40105 GPN2YOR262W 1044 nt13.12□□□□□ -0.31
YRF1-2P40105 SHH4YLR164W 507 nt13.12□□□□□ -0.31
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