Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.15□□□□□ -0.78
SOP4P39543 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.15□□□□□ -0.78
SOP4P39543 YLR464WYLR464W 651 nt10.15□□□□□ -0.78
SOP4P39543 DIC1YLR348C 897 nt10.14□□□□□ -0.79
SOP4P39543 DDR2YOL052C-A 186 nt10.14□□□□□ -0.79
SOP4P39543 DPS1YLL018C 1674 nt10.12□□□□□ -0.79
SOP4P39543 AAC1YMR056C 930 nt10.11□□□□□ -0.79
SOP4P39543 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.09□□□□□ -0.79
SOP4P39543 RPM1RPM1 483 nt10.08□□□□□ -0.8
SOP4P39543 BNA2YJR078W 1362 nt10.05□□□□□ -0.8
SOP4P39543 ANP1YEL036C 1503 nt10.04□□□□□ -0.8
SOP4P39543 YKR005CYKR005C 1578 nt10.04□□□□□ -0.8
SOP4P39543 YJL225CYJL225C 5277 nt10.03□□□□□ -0.8
SOP4P39543 BMT6YLR063W 1098 nt10.03□□□□□ -0.8
SOP4P39543 NAR1YNL240C 1476 nt10.03□□□□□ -0.8
SOP4P39543 AGP1YCL025C 1902 nt10.01□□□□□ -0.81
SOP4P39543 DUS1YML080W 1272 nt10.01□□□□□ -0.81
SOP4P39543 WSC2YNL283C 1512 nt9.99□□□□□ -0.81
SOP4P39543 MIC12YBR262C 321 nt9.99□□□□□ -0.81
SOP4P39543 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.98□□□□□ -0.81
SOP4P39543 BIO5YNR056C 1686 nt9.98□□□□□ -0.81
SOP4P39543 SNF1YDR477W 1902 nt9.97□□□□□ -0.81
SOP4P39543 STB1YNL309W 1263 nt9.97□□□□□ -0.81
SOP4P39543 AQY1YPR192W 918 nt9.97□□□□□ -0.81
SOP4P39543 YCL074WYCL074W 927 nt9.95□□□□□ -0.82
SOP4P39543 PTH1YHR189W 573 nt9.95□□□□□ -0.82
SOP4P39543 FEN2YCR028C 1539 nt9.95□□□□□ -0.82
SOP4P39543 YGR259CYGR259C 441 nt9.94□□□□□ -0.82
SOP4P39543 HHO1YPL127C 777 nt9.93□□□□□ -0.82
SOP4P39543 SPC25YER018C 666 nt9.92□□□□□ -0.82
SOP4P39543 GPI16YHR188C 1833 nt9.89□□□□□ -0.83
SOP4P39543 YLR179CYLR179C 606 nt9.89□□□□□ -0.83
SOP4P39543 TIM23YNR017W 669 nt9.89□□□□□ -0.83
SOP4P39543 YIR016WYIR016W 798 nt9.87□□□□□ -0.83
SOP4P39543 VPS60YDR486C 690 nt9.86□□□□□ -0.83
SOP4P39543 IRC24YIR036C 792 nt9.85□□□□□ -0.83
SOP4P39543 PBP1YGR178C 2169 nt9.84□□□□□ -0.83
SOP4P39543 YLR235CYLR235C 399 nt9.84□□□□□ -0.83
SOP4P39543 XDJ1YLR090W 1380 nt9.84□□□□□ -0.83
SOP4P39543 CYT2YKL087C 675 nt9.83□□□□□ -0.84
SOP4P39543 SPP1YPL138C 1062 nt9.83□□□□□ -0.84
SOP4P39543 CCT4YDL143W 1587 nt9.83□□□□□ -0.84
SOP4P39543 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.82□□□□□ -0.84
SOP4P39543 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.82□□□□□ -0.84
SOP4P39543 ALG3YBL082C 1377 nt9.82□□□□□ -0.84
SOP4P39543 DUT1YBR252W 444 nt9.81□□□□□ -0.84
SOP4P39543 YGR201CYGR201C 678 nt9.79□□□□□ -0.84
SOP4P39543 SWC5YBR231C 912 nt9.79□□□□□ -0.84
SOP4P39543 STR3YGL184C 1398 nt9.78□□□□□ -0.84
SOP4P39543 MOT3YMR070W 1473 nt9.78□□□□□ -0.84
SOP4P39543 AHT1YHR093W 549 nt9.76□□□□□ -0.85
SOP4P39543 AQY2YLL052C 450 nt9.75□□□□□ -0.85
SOP4P39543 AVT6YER119C 1347 nt9.71□□□□□ -0.86
SOP4P39543 YKL030WYKL030W 606 nt9.69□□□□□ -0.86
SOP4P39543 GOR1YNL274C 1053 nt9.68□□□□□ -0.86
SOP4P39543 YPR064WYPR064W 420 nt9.68□□□□□ -0.86
SOP4P39543 GDH3YAL062W 1374 nt9.66□□□□□ -0.86
SOP4P39543 CMP2YML057W 1815 nt9.66□□□□□ -0.86
SOP4P39543 RTN2YDL204W 1182 nt9.63□□□□□ -0.87
SOP4P39543 YAT1YAR035W 2064 nt9.63□□□□□ -0.87
SOP4P39543 TAD3YLR316C 969 nt9.61□□□□□ -0.87
SOP4P39543 SHM2YLR058C 1410 nt9.54□□□□□ -0.88
SOP4P39543 BDH1YAL060W 1149 nt9.53□□□□□ -0.88
SOP4P39543 NDI1YML120C 1542 nt9.51□□□□□ -0.89
SOP4P39543 YLR415CYLR415C 339 nt9.5□□□□□ -0.89
SOP4P39543 PLB1YMR008C 1995 nt9.48□□□□□ -0.89
SOP4P39543 TIM17YJL143W 477 nt9.46□□□□□ -0.9
SOP4P39543 PRM5YIL117C 957 nt9.45□□□□□ -0.9
SOP4P39543 HIF1YLL022C 1158 nt9.45□□□□□ -0.9
SOP4P39543 NIT1YIL164C 600 nt9.44□□□□□ -0.9
SOP4P39543 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.44□□□□□ -0.9
SOP4P39543 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.44□□□□□ -0.9
SOP4P39543 NBP35YGL091C 987 nt9.43□□□□□ -0.9
SOP4P39543 DAT1YML113W 747 nt9.43□□□□□ -0.9
SOP4P39543 ALD4YOR374W 1560 nt9.41□□□□□ -0.9
SOP4P39543 HSL7YBR133C 2484 nt9.4□□□□□ -0.9
SOP4P39543 ARP6YLR085C 1317 nt9.4□□□□□ -0.9
SOP4P39543 SPT20YOL148C 1815 nt9.4□□□□□ -0.91
SOP4P39543 YCR102CYCR102C 1107 nt9.39□□□□□ -0.91
SOP4P39543 INA1YLR413W 2028 nt9.38□□□□□ -0.91
SOP4P39543 SGT2YOR007C 1041 nt9.38□□□□□ -0.91
SOP4P39543 YSP3YOR003W 1437 nt9.38□□□□□ -0.91
SOP4P39543 RPC82YPR190C 1965 nt9.37□□□□□ -0.91
SOP4P39543 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.37□□□□□ -0.91
SOP4P39543 RTG1YOL067C 534 nt9.37□□□□□ -0.91
SOP4P39543 UTR1YJR049C 1593 nt9.33□□□□□ -0.92
SOP4P39543 YNL115CYNL115C 1935 nt9.28□□□□□ -0.92
SOP4P39543 FRE6YLL051C 2139 nt9.25□□□□□ -0.93
SOP4P39543 SSN3YPL042C 1668 nt9.25□□□□□ -0.93
SOP4P39543 GAP1YKR039W 1809 nt9.24□□□□□ -0.93
SOP4P39543 SHH4YLR164W 507 nt9.22□□□□□ -0.93
SOP4P39543 ZRT3YKL175W 1512 nt9.21□□□□□ -0.93
SOP4P39543 SAM35YHR083W 990 nt9.21□□□□□ -0.94
SOP4P39543 TIR3YIL011W 810 nt9.21□□□□□ -0.94
SOP4P39543 PRO1YDR300C 1287 nt9.2□□□□□ -0.94
SOP4P39543 LSC2YGR244C 1284 nt9.19□□□□□ -0.94
SOP4P39543 HUA1YGR268C 597 nt9.19□□□□□ -0.94
SOP4P39543 PEX25YPL112C 1185 nt9.19□□□□□ -0.94
SOP4P39543 RIM8YGL045W 1629 nt9.17□□□□□ -0.94
SOP4P39543 MUP1YGR055W 1725 nt9.17□□□□□ -0.94
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