Protein–RNA interactions for Protein: P39542

YJL193W, Uncharacterized transporter YJL193W, yeastyeast

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL193WP39542 WSC2YNL283C 1512 nt9.93□□□□□ -0.82
YJL193WP39542 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.93□□□□□ -0.82
YJL193WP39542 NVJ2YPR091C 2313 nt9.92□□□□□ -0.82
YJL193WP39542 TAD3YLR316C 969 nt9.92□□□□□ -0.82
YJL193WP39542 DDR2YOL052C-A 186 nt9.92□□□□□ -0.82
YJL193WP39542 ATF2YGR177C 1608 nt9.92□□□□□ -0.82
YJL193WP39542 LYS4YDR234W 2082 nt9.91□□□□□ -0.82
YJL193WP39542 PTK1YKL198C 1989 nt9.91□□□□□ -0.82
YJL193WP39542 SPC25YER018C 666 nt9.89□□□□□ -0.83
YJL193WP39542 STB1YNL309W 1263 nt9.89□□□□□ -0.83
YJL193WP39542 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.87□□□□□ -0.83
YJL193WP39542 HEM12YDR047W 1089 nt9.86□□□□□ -0.83
YJL193WP39542 GPI16YHR188C 1833 nt9.85□□□□□ -0.83
YJL193WP39542 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.84□□□□□ -0.83
YJL193WP39542 YDR094WYDR094W 336 nt9.83□□□□□ -0.84
YJL193WP39542 ANP1YEL036C 1503 nt9.82□□□□□ -0.84
YJL193WP39542 SNG1YGR197C 1644 nt9.82□□□□□ -0.84
YJL193WP39542 CCT4YDL143W 1587 nt9.82□□□□□ -0.84
YJL193WP39542 MIC10YCL057C-A 294 nt9.78□□□□□ -0.84
YJL193WP39542 FEN2YCR028C 1539 nt9.77□□□□□ -0.84
YJL193WP39542 VPS60YDR486C 690 nt9.76□□□□□ -0.85
YJL193WP39542 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.76□□□□□ -0.85
YJL193WP39542 UBX6YJL048C 1191 nt9.76□□□□□ -0.85
YJL193WP39542 SWC5YBR231C 912 nt9.76□□□□□ -0.85
YJL193WP39542 YFL054CYFL054C 1941 nt9.76□□□□□ -0.85
YJL193WP39542 YFR018CYFR018C 1092 nt9.75□□□□□ -0.85
YJL193WP39542 BDH1YAL060W 1149 nt9.75□□□□□ -0.85
YJL193WP39542 YLR415CYLR415C 339 nt9.74□□□□□ -0.85
YJL193WP39542 RAX1YOR301W 1308 nt9.7□□□□□ -0.86
YJL193WP39542 ALG3YBL082C 1377 nt9.7□□□□□ -0.86
YJL193WP39542 YSP3YOR003W 1437 nt9.7□□□□□ -0.86
YJL193WP39542 YIR016WYIR016W 798 nt9.69□□□□□ -0.86
YJL193WP39542 BNA2YJR078W 1362 nt9.67□□□□□ -0.86
YJL193WP39542 SPT8YLR055C 1809 nt9.67□□□□□ -0.86
YJL193WP39542 PEX25YPL112C 1185 nt9.66□□□□□ -0.86
YJL193WP39542 MIC12YBR262C 321 nt9.65□□□□□ -0.86
YJL193WP39542 RRT5YFR032C 870 nt9.64□□□□□ -0.87
YJL193WP39542 YNL115CYNL115C 1935 nt9.61□□□□□ -0.87
YJL193WP39542 YFL066CYFL066C 1179 nt9.57□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 PRE6YOL038W 765 nt9.57□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 NME1NME1 340 nt9.57□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 YGR201CYGR201C 678 nt9.56□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 VPS75YNL246W 795 nt9.56□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 SWE1YJL187C 2460 nt9.56□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 TIM17YJL143W 477 nt9.55□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 PAU16YKL224C 372 nt9.55□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 HHO1YPL127C 777 nt9.53□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 XDJ1YLR090W 1380 nt9.52□□□□□ -0.88
YJL193WP39542 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.49□□□□□ -0.89
YJL193WP39542 CCA1YER168C 1641 nt9.49□□□□□ -0.89
YJL193WP39542 SHM2YLR058C 1410 nt9.48□□□□□ -0.89
YJL193WP39542 GDH3YAL062W 1374 nt9.46□□□□□ -0.9
YJL193WP39542 RPM1RPM1 483 nt9.41□□□□□ -0.9
YJL193WP39542 AVT6YER119C 1347 nt9.4□□□□□ -0.9
YJL193WP39542 NIT1YIL164C 600 nt9.4□□□□□ -0.9
YJL193WP39542 GLK1YCL040W 1503 nt9.4□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 MIR1YJR077C 936 nt9.39□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 PAU7YAR020C 168 nt9.39□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 NAT4YMR069W 858 nt9.39□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 AGP1YCL025C 1902 nt9.39□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 GOR1YNL274C 1053 nt9.38□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 DAT1YML113W 747 nt9.37□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 SGT2YOR007C 1041 nt9.37□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 THI74YDR438W 1113 nt9.34□□□□□ -0.91
YJL193WP39542 MSF1YPR047W 1410 nt9.31□□□□□ -0.92
YJL193WP39542 YCR102CYCR102C 1107 nt9.29□□□□□ -0.92
YJL193WP39542 DUS1YML080W 1272 nt9.29□□□□□ -0.92
YJL193WP39542 YCL074WYCL074W 927 nt9.28□□□□□ -0.92
YJL193WP39542 SHB17YKR043C 816 nt9.28□□□□□ -0.92
YJL193WP39542 DUT1YBR252W 444 nt9.27□□□□□ -0.93
YJL193WP39542 UBA4YHR111W 1323 nt9.27□□□□□ -0.93
YJL193WP39542 YDR010CYDR010C 333 nt9.25□□□□□ -0.93
YJL193WP39542 FUR4YBR021W 1902 nt9.25□□□□□ -0.93
YJL193WP39542 RET2YFR051C 1641 nt9.22□□□□□ -0.93
YJL193WP39542 STR3YGL184C 1398 nt9.22□□□□□ -0.93
YJL193WP39542 YCR087WYCR087W 516 nt9.19□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 NBP35YGL091C 987 nt9.19□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 YSR3YKR053C 1215 nt9.19□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 YGL034CYGL034C 366 nt9.17□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 AQY2YLL052C 450 nt9.17□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.17□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.17□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 FRE6YLL051C 2139 nt9.16□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 UME6YDR207C 2511 nt9.16□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 PHO89YBR296C 1725 nt9.16□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 TIR3YIL011W 810 nt9.15□□□□□ -0.94
YJL193WP39542 HSP60YLR259C 1719 nt9.13□□□□□ -0.95
YJL193WP39542 RTN2YDL204W 1182 nt9.11□□□□□ -0.95
YJL193WP39542 LSC2YGR244C 1284 nt9.11□□□□□ -0.95
YJL193WP39542 SFA1YDL168W 1161 nt9.1□□□□□ -0.95
YJL193WP39542 XYL2YLR070C 1071 nt9.09□□□□□ -0.95
YJL193WP39542 ARP6YLR085C 1317 nt9.08□□□□□ -0.96
YJL193WP39542 MRP20YDR405W 792 nt9.08□□□□□ -0.96
YJL193WP39542 AIM45YPR004C 1035 nt9.08□□□□□ -0.96
YJL193WP39542 BOR1YNL275W 1731 nt9.08□□□□□ -0.96
YJL193WP39542 YKR005CYKR005C 1578 nt9.07□□□□□ -0.96
YJL193WP39542 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.07□□□□□ -0.96
YJL193WP39542 SBA1YKL117W 651 nt9.07□□□□□ -0.96
YJL193WP39542 PRP4YPR178W 1398 nt9.07□□□□□ -0.96
YJL193WP39542 YGR259CYGR259C 441 nt9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms