Protein–RNA interactions for Protein: P38753

HSE1, Class E vacuolar protein-sorting machinery protein HSE1, yeastyeast

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSE1P38753 YPR064WYPR064W 420 nt10.79□□□□□ -0.68
HSE1P38753 ATF2YGR177C 1608 nt10.78□□□□□ -0.68
HSE1P38753 PTK1YKL198C 1989 nt10.77□□□□□ -0.68
HSE1P38753 CRR1YLR213C 1269 nt10.76□□□□□ -0.69
HSE1P38753 DDR2YOL052C-A 186 nt10.76□□□□□ -0.69
HSE1P38753 AQY1YPR192W 918 nt10.76□□□□□ -0.69
HSE1P38753 LYS4YDR234W 2082 nt10.76□□□□□ -0.69
HSE1P38753 WSC2YNL283C 1512 nt10.75□□□□□ -0.69
HSE1P38753 YFL067WYFL067W 528 nt10.74□□□□□ -0.69
HSE1P38753 AHT1YHR093W 549 nt10.73□□□□□ -0.69
HSE1P38753 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.71□□□□□ -0.69
HSE1P38753 TAD3YLR316C 969 nt10.71□□□□□ -0.69
HSE1P38753 STB1YNL309W 1263 nt10.7□□□□□ -0.7
HSE1P38753 HEM12YDR047W 1089 nt10.69□□□□□ -0.7
HSE1P38753 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.69□□□□□ -0.7
HSE1P38753 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.67□□□□□ -0.7
HSE1P38753 MIC10YCL057C-A 294 nt10.67□□□□□ -0.7
HSE1P38753 SNG1YGR197C 1644 nt10.66□□□□□ -0.7
HSE1P38753 SPC25YER018C 666 nt10.65□□□□□ -0.7
HSE1P38753 GPI16YHR188C 1833 nt10.64□□□□□ -0.71
HSE1P38753 YFL054CYFL054C 1941 nt10.64□□□□□ -0.71
HSE1P38753 CCT4YDL143W 1587 nt10.63□□□□□ -0.71
HSE1P38753 UBX6YJL048C 1191 nt10.62□□□□□ -0.71
HSE1P38753 SWC5YBR231C 912 nt10.61□□□□□ -0.71
HSE1P38753 FEN2YCR028C 1539 nt10.6□□□□□ -0.71
HSE1P38753 ANP1YEL036C 1503 nt10.6□□□□□ -0.71
HSE1P38753 VPS60YDR486C 690 nt10.6□□□□□ -0.71
HSE1P38753 YDR094WYDR094W 336 nt10.59□□□□□ -0.71
HSE1P38753 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.54□□□□□ -0.72
HSE1P38753 BDH1YAL060W 1149 nt10.54□□□□□ -0.72
HSE1P38753 ALG3YBL082C 1377 nt10.53□□□□□ -0.72
HSE1P38753 YLR415CYLR415C 339 nt10.53□□□□□ -0.72
HSE1P38753 UME6YDR207C 2511 nt10.51□□□□□ -0.73
HSE1P38753 BNA2YJR078W 1362 nt10.51□□□□□ -0.73
HSE1P38753 BSP1YPR171W 1731 nt10.5□□□□□ -0.73
HSE1P38753 YIR016WYIR016W 798 nt10.49□□□□□ -0.73
HSE1P38753 YFR018CYFR018C 1092 nt10.48□□□□□ -0.73
HSE1P38753 SPT8YLR055C 1809 nt10.48□□□□□ -0.73
HSE1P38753 RAX1YOR301W 1308 nt10.48□□□□□ -0.73
HSE1P38753 CSM2YIL132C 642 nt10.46□□□□□ -0.73
HSE1P38753 YSP3YOR003W 1437 nt10.46□□□□□ -0.74
HSE1P38753 YFL066CYFL066C 1179 nt10.45□□□□□ -0.74
HSE1P38753 SSN3YPL042C 1668 nt10.44□□□□□ -0.74
HSE1P38753 PRE6YOL038W 765 nt10.44□□□□□ -0.74
HSE1P38753 PEX25YPL112C 1185 nt10.44□□□□□ -0.74
HSE1P38753 YNL115CYNL115C 1935 nt10.44□□□□□ -0.74
HSE1P38753 RRT5YFR032C 870 nt10.41□□□□□ -0.74
HSE1P38753 MIC12YBR262C 321 nt10.4□□□□□ -0.74
HSE1P38753 PAU16YKL224C 372 nt10.38□□□□□ -0.75
HSE1P38753 SWE1YJL187C 2460 nt10.36□□□□□ -0.75
HSE1P38753 HHO1YPL127C 777 nt10.36□□□□□ -0.75
HSE1P38753 XDJ1YLR090W 1380 nt10.34□□□□□ -0.75
HSE1P38753 TIM17YJL143W 477 nt10.33□□□□□ -0.76
HSE1P38753 CCA1YER168C 1641 nt10.32□□□□□ -0.76
HSE1P38753 SHM2YLR058C 1410 nt10.3□□□□□ -0.76
HSE1P38753 GDH3YAL062W 1374 nt10.29□□□□□ -0.76
HSE1P38753 YGR201CYGR201C 678 nt10.28□□□□□ -0.76
HSE1P38753 VPS75YNL246W 795 nt10.27□□□□□ -0.77
HSE1P38753 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.24□□□□□ -0.77
HSE1P38753 PAU7YAR020C 168 nt10.23□□□□□ -0.77
HSE1P38753 AVT6YER119C 1347 nt10.23□□□□□ -0.77
HSE1P38753 AGP1YCL025C 1902 nt10.23□□□□□ -0.77
HSE1P38753 GLK1YCL040W 1503 nt10.2□□□□□ -0.78
HSE1P38753 DUS1YML080W 1272 nt10.19□□□□□ -0.78
HSE1P38753 GOR1YNL274C 1053 nt10.19□□□□□ -0.78
HSE1P38753 SGT2YOR007C 1041 nt10.19□□□□□ -0.78
HSE1P38753 NIT1YIL164C 600 nt10.17□□□□□ -0.78
HSE1P38753 NAT4YMR069W 858 nt10.17□□□□□ -0.78
HSE1P38753 DUT1YBR252W 444 nt10.16□□□□□ -0.78
HSE1P38753 MIR1YJR077C 936 nt10.15□□□□□ -0.78
HSE1P38753 MET8YBR213W 825 nt10.14□□□□□ -0.79
HSE1P38753 THI74YDR438W 1113 nt10.12□□□□□ -0.79
HSE1P38753 PAU21YOR394W 495 nt10.09□□□□□ -0.79
HSE1P38753 PAU22YPL282C 495 nt10.09□□□□□ -0.79
HSE1P38753 SHB17YKR043C 816 nt10.08□□□□□ -0.8
HSE1P38753 DAT1YML113W 747 nt10.08□□□□□ -0.8
HSE1P38753 MSF1YPR047W 1410 nt10.07□□□□□ -0.8
HSE1P38753 FUR4YBR021W 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
HSE1P38753 YCL074WYCL074W 927 nt10.03□□□□□ -0.8
HSE1P38753 YCR102CYCR102C 1107 nt10.03□□□□□ -0.8
HSE1P38753 AQY2YLL052C 450 nt10.03□□□□□ -0.8
HSE1P38753 UBA4YHR111W 1323 nt10.03□□□□□ -0.8
HSE1P38753 ARO7YPR060C 771 nt10.02□□□□□ -0.81
HSE1P38753 YDR010CYDR010C 333 nt10.01□□□□□ -0.81
HSE1P38753 YSR3YKR053C 1215 nt10□□□□□ -0.81
HSE1P38753 STR3YGL184C 1398 nt10□□□□□ -0.81
HSE1P38753 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.99□□□□□ -0.81
HSE1P38753 GID7YCL039W 2238 nt9.99□□□□□ -0.81
HSE1P38753 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.98□□□□□ -0.81
HSE1P38753 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.98□□□□□ -0.81
HSE1P38753 PHO89YBR296C 1725 nt9.96□□□□□ -0.82
HSE1P38753 CLB6YGR109C 1143 nt9.95□□□□□ -0.82
HSE1P38753 RET2YFR051C 1641 nt9.94□□□□□ -0.82
HSE1P38753 YGL034CYGL034C 366 nt9.94□□□□□ -0.82
HSE1P38753 XYL2YLR070C 1071 nt9.93□□□□□ -0.82
HSE1P38753 NBP35YGL091C 987 nt9.92□□□□□ -0.82
HSE1P38753 HSP60YLR259C 1719 nt9.91□□□□□ -0.82
HSE1P38753 SBA1YKL117W 651 nt9.89□□□□□ -0.83
HSE1P38753 MAS1YLR163C 1389 nt9.88□□□□□ -0.83
HSE1P38753 BOR1YNL275W 1731 nt9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms