Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 LPX1YOR084W 1164 nt9.03□□□□□ -0.96
AVT5P38176 YKR005CYKR005C 1578 nt9.01□□□□□ -0.97
AVT5P38176 YAT1YAR035W 2064 nt8.99□□□□□ -0.97
AVT5P38176 NDI1YML120C 1542 nt8.98□□□□□ -0.97
AVT5P38176 FRD1YEL047C 1413 nt8.97□□□□□ -0.97
AVT5P38176 YIH1YCR059C 777 nt8.95□□□□□ -0.98
AVT5P38176 CCA1YER168C 1641 nt8.94□□□□□ -0.98
AVT5P38176 ERF2YLR246W 1080 nt8.94□□□□□ -0.98
AVT5P38176 RNQ1YCL028W 1218 nt8.93□□□□□ -0.98
AVT5P38176 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.92□□□□□ -0.98
AVT5P38176 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.92□□□□□ -0.98
AVT5P38176 IRC24YIR036C 792 nt8.9□□□□□ -0.98
AVT5P38176 SNG1YGR197C 1644 nt8.89□□□□□ -0.99
AVT5P38176 YLL053CYLL053C 459 nt8.88□□□□□ -0.99
AVT5P38176 RIM8YGL045W 1629 nt8.87□□□□□ -0.99
AVT5P38176 CRR1YLR213C 1269 nt8.87□□□□□ -0.99
AVT5P38176 YGR259CYGR259C 441 nt8.86□□□□□ -0.99
AVT5P38176 RPM1RPM1 483 nt8.86□□□□□ -0.99
AVT5P38176 MET2YNL277W 1461 nt8.85□□□□□ -0.99
AVT5P38176 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.84□□□□□ -0.99
AVT5P38176 DIC1YLR348C 897 nt8.84□□□□□ -0.99
AVT5P38176 SPT20YOL148C 1815 nt8.84□□□□□ -0.99
AVT5P38176 YFL067WYFL067W 528 nt8.83□□□□□ -1
AVT5P38176 FTR1YER145C 1215 nt8.82□□□□□ -1
AVT5P38176 HEM12YDR047W 1089 nt8.81□□□□□ -1
AVT5P38176 WSC2YNL283C 1512 nt8.8□□□□□ -1
AVT5P38176 ATF2YGR177C 1608 nt8.8□□□□□ -1
AVT5P38176 RAX1YOR301W 1308 nt8.79□□□□□ -1
AVT5P38176 GAL1YBR020W 1587 nt8.78□□□□□ -1
AVT5P38176 YLR235CYLR235C 399 nt8.78□□□□□ -1
AVT5P38176 DDR2YOL052C-A 186 nt8.78□□□□□ -1
AVT5P38176 AQY1YPR192W 918 nt8.77□□□□□ -1.01
AVT5P38176 TRM5YHR070W 1500 nt8.76□□□□□ -1.01
AVT5P38176 MIC10YCL057C-A 294 nt8.74□□□□□ -1.01
AVT5P38176 MAE1YKL029C 2010 nt8.74□□□□□ -1.01
AVT5P38176 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.73□□□□□ -1.01
AVT5P38176 PTH1YHR189W 573 nt8.72□□□□□ -1.01
AVT5P38176 SPP1YPL138C 1062 nt8.72□□□□□ -1.01
AVT5P38176 YGL114WYGL114W 2178 nt8.72□□□□□ -1.01
AVT5P38176 SFP1YLR403W 2052 nt8.71□□□□□ -1.01
AVT5P38176 DUS1YML080W 1272 nt8.71□□□□□ -1.02
AVT5P38176 TIM23YNR017W 669 nt8.71□□□□□ -1.02
AVT5P38176 YCL074WYCL074W 927 nt8.7□□□□□ -1.02
AVT5P38176 ANP1YEL036C 1503 nt8.69□□□□□ -1.02
AVT5P38176 INA1YLR413W 2028 nt8.68□□□□□ -1.02
AVT5P38176 YLR179CYLR179C 606 nt8.68□□□□□ -1.02
AVT5P38176 GPI16YHR188C 1833 nt8.68□□□□□ -1.02
AVT5P38176 RPC82YPR190C 1965 nt8.68□□□□□ -1.02
AVT5P38176 SPC25YER018C 666 nt8.66□□□□□ -1.02
AVT5P38176 STB1YNL309W 1263 nt8.66□□□□□ -1.02
AVT5P38176 BNA2YJR078W 1362 nt8.65□□□□□ -1.02
AVT5P38176 YKL030WYKL030W 606 nt8.65□□□□□ -1.02
AVT5P38176 MUP1YGR055W 1725 nt8.64□□□□□ -1.03
AVT5P38176 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.64□□□□□ -1.03
AVT5P38176 FEN2YCR028C 1539 nt8.62□□□□□ -1.03
AVT5P38176 AHT1YHR093W 549 nt8.61□□□□□ -1.03
AVT5P38176 YPR064WYPR064W 420 nt8.6□□□□□ -1.03
AVT5P38176 MIC12YBR262C 321 nt8.59□□□□□ -1.03
AVT5P38176 CCT4YDL143W 1587 nt8.57□□□□□ -1.04
AVT5P38176 NPP1YCR026C 2229 nt8.57□□□□□ -1.04
AVT5P38176 ACO2YJL200C 2370 nt8.55□□□□□ -1.04
AVT5P38176 VPS60YDR486C 690 nt8.55□□□□□ -1.04
AVT5P38176 YIR016WYIR016W 798 nt8.55□□□□□ -1.04
AVT5P38176 AGP1YCL025C 1902 nt8.54□□□□□ -1.04
AVT5P38176 SWC5YBR231C 912 nt8.53□□□□□ -1.04
AVT5P38176 TAD3YLR316C 969 nt8.52□□□□□ -1.05
AVT5P38176 HHO1YPL127C 777 nt8.52□□□□□ -1.05
AVT5P38176 RTG1YOL067C 534 nt8.5□□□□□ -1.05
AVT5P38176 TPO4YOR273C 1980 nt8.5□□□□□ -1.05
AVT5P38176 YGR201CYGR201C 678 nt8.49□□□□□ -1.05
AVT5P38176 UGA4YDL210W 1716 nt8.49□□□□□ -1.05
AVT5P38176 ALG3YBL082C 1377 nt8.48□□□□□ -1.05
AVT5P38176 HMG2YLR450W 3138 nt8.45□□□□□ -1.06
AVT5P38176 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.44□□□□□ -1.06
AVT5P38176 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.44□□□□□ -1.06
AVT5P38176 HOL1YNR055C 1761 nt8.43□□□□□ -1.06
AVT5P38176 YMR209CYMR209C 1374 nt8.43□□□□□ -1.06
AVT5P38176 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.42□□□□□ -1.06
AVT5P38176 HUA1YGR268C 597 nt8.42□□□□□ -1.06
AVT5P38176 GDH3YAL062W 1374 nt8.41□□□□□ -1.06
AVT5P38176 YLR415CYLR415C 339 nt8.4□□□□□ -1.06
AVT5P38176 MRPL8YJL063C 717 nt8.39□□□□□ -1.07
AVT5P38176 GID7YCL039W 2238 nt8.38□□□□□ -1.07
AVT5P38176 BDH1YAL060W 1149 nt8.38□□□□□ -1.07
AVT5P38176 STR3YGL184C 1398 nt8.37□□□□□ -1.07
AVT5P38176 XDJ1YLR090W 1380 nt8.37□□□□□ -1.07
AVT5P38176 ADO1YJR105W 1023 nt8.36□□□□□ -1.07
AVT5P38176 HIF1YLL022C 1158 nt8.35□□□□□ -1.07
AVT5P38176 GOR1YNL274C 1053 nt8.35□□□□□ -1.07
AVT5P38176 URA8YJR103W 1737 nt8.34□□□□□ -1.07
AVT5P38176 AVT6YER119C 1347 nt8.33□□□□□ -1.08
AVT5P38176 DUT1YBR252W 444 nt8.33□□□□□ -1.08
AVT5P38176 RTN2YDL204W 1182 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT5P38176 AQY2YLL052C 450 nt8.32□□□□□ -1.08
AVT5P38176 TIM17YJL143W 477 nt8.31□□□□□ -1.08
AVT5P38176 YSP3YOR003W 1437 nt8.3□□□□□ -1.08
AVT5P38176 YHL008CYHL008C 1884 nt8.29□□□□□ -1.08
AVT5P38176 SHM2YLR058C 1410 nt8.29□□□□□ -1.08
AVT5P38176 YNL024CYNL024C 741 nt8.27□□□□□ -1.09
AVT5P38176 ALD4YOR374W 1560 nt8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.4 ms