Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 VPS75YNL246W 795 nt14.26□□□□□ -0.13
PRP45P28004 CCT4YDL143W 1587 nt14.26□□□□□ -0.13
PRP45P28004 TRM5YHR070W 1500 nt14.25□□□□□ -0.13
PRP45P28004 SPC25YER018C 666 nt14.24□□□□□ -0.13
PRP45P28004 STB1YNL309W 1263 nt14.24□□□□□ -0.13
PRP45P28004 DAT1YML113W 747 nt14.22□□□□□ -0.13
PRP45P28004 YBR220CYBR220C 1683 nt14.21□□□□□ -0.13
PRP45P28004 YNL195CYNL195C 786 nt14.21□□□□□ -0.13
PRP45P28004 SIM1YIL123W 1431 nt14.18□□□□□ -0.14
PRP45P28004 RBG2YGR173W 1107 nt14.18□□□□□ -0.14
PRP45P28004 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt14.16□□□□□ -0.14
PRP45P28004 GPI16YHR188C 1833 nt14.15□□□□□ -0.14
PRP45P28004 VPS60YDR486C 690 nt14.14□□□□□ -0.15
PRP45P28004 YGL034CYGL034C 366 nt14.14□□□□□ -0.15
PRP45P28004 SWC5YBR231C 912 nt14.14□□□□□ -0.15
PRP45P28004 RRT12YCR045C 1476 nt14.12□□□□□ -0.15
PRP45P28004 SPT8YLR055C 1809 nt14.09□□□□□ -0.15
PRP45P28004 DDR2YOL052C-A 186 nt14.09□□□□□ -0.15
PRP45P28004 ALG3YBL082C 1377 nt14.09□□□□□ -0.15
PRP45P28004 ATF2YGR177C 1608 nt14.08□□□□□ -0.16
PRP45P28004 PAU7YAR020C 168 nt14.06□□□□□ -0.16
PRP45P28004 UBA4YHR111W 1323 nt14.05□□□□□ -0.16
PRP45P28004 NDI1YML120C 1542 nt14.04□□□□□ -0.16
PRP45P28004 YFL067WYFL067W 528 nt14.02□□□□□ -0.17
PRP45P28004 FEN2YCR028C 1539 nt14□□□□□ -0.17
PRP45P28004 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt14□□□□□ -0.17
PRP45P28004 YSR3YKR053C 1215 nt13.97□□□□□ -0.17
PRP45P28004 RBG1YAL036C 1110 nt13.96□□□□□ -0.17
PRP45P28004 SHB17YKR043C 816 nt13.96□□□□□ -0.17
PRP45P28004 ERF2YLR246W 1080 nt13.96□□□□□ -0.17
PRP45P28004 SSA4YER103W 1929 nt13.95□□□□□ -0.18
PRP45P28004 YHL050CYHL050C 2094 nt13.95□□□□□ -0.18
PRP45P28004 ANP1YEL036C 1503 nt13.95□□□□□ -0.18
PRP45P28004 XYL2YLR070C 1071 nt13.94□□□□□ -0.18
PRP45P28004 TIM17YJL143W 477 nt13.88□□□□□ -0.19
PRP45P28004 CRR1YLR213C 1269 nt13.88□□□□□ -0.19
PRP45P28004 YIR016WYIR016W 798 nt13.86□□□□□ -0.19
PRP45P28004 YMR226CYMR226C 804 nt13.85□□□□□ -0.19
PRP45P28004 YDR010CYDR010C 333 nt13.84□□□□□ -0.19
PRP45P28004 SAM1YLR180W 1149 nt13.84□□□□□ -0.19
PRP45P28004 SNG1YGR197C 1644 nt13.82□□□□□ -0.2
PRP45P28004 SHM2YLR058C 1410 nt13.78□□□□□ -0.2
PRP45P28004 MIC10YCL057C-A 294 nt13.75□□□□□ -0.21
PRP45P28004 YCR087WYCR087W 516 nt13.74□□□□□ -0.21
PRP45P28004 HEM12YDR047W 1089 nt13.74□□□□□ -0.21
PRP45P28004 AIM45YPR004C 1035 nt13.74□□□□□ -0.21
PRP45P28004 PHO89YBR296C 1725 nt13.73□□□□□ -0.21
PRP45P28004 RET2YFR051C 1641 nt13.73□□□□□ -0.21
PRP45P28004 RAD51YER095W 1203 nt13.73□□□□□ -0.21
PRP45P28004 SGT2YOR007C 1041 nt13.69□□□□□ -0.22
PRP45P28004 NIT1YIL164C 600 nt13.68□□□□□ -0.22
PRP45P28004 RPM1RPM1 483 nt13.68□□□□□ -0.22
PRP45P28004 LYS4YDR234W 2082 nt13.66□□□□□ -0.22
PRP45P28004 XDJ1YLR090W 1380 nt13.66□□□□□ -0.22
PRP45P28004 NCP1YHR042W 2076 nt13.6□□□□□ -0.23
PRP45P28004 YLR111WYLR111W 333 nt13.57□□□□□ -0.24
PRP45P28004 MRP20YDR405W 792 nt13.56□□□□□ -0.24
PRP45P28004 COQ2YNR041C 1119 nt13.55□□□□□ -0.24
PRP45P28004 GDH3YAL062W 1374 nt13.55□□□□□ -0.24
PRP45P28004 SEC11YIR022W 504 nt13.54□□□□□ -0.24
PRP45P28004 YNR029CYNR029C 1290 nt13.51□□□□□ -0.25
PRP45P28004 MIC12YBR262C 321 nt13.47□□□□□ -0.25
PRP45P28004 BNA2YJR078W 1362 nt13.46□□□□□ -0.25
PRP45P28004 YLR349WYLR349W 507 nt13.44□□□□□ -0.26
PRP45P28004 STE4YOR212W 1272 nt13.44□□□□□ -0.26
PRP45P28004 SFA1YDL168W 1161 nt13.41□□□□□ -0.26
PRP45P28004 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.37□□□□□ -0.27
PRP45P28004 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.37□□□□□ -0.27
PRP45P28004 YGR201CYGR201C 678 nt13.36□□□□□ -0.27
PRP45P28004 SDH5YOL071W 489 nt13.36□□□□□ -0.27
PRP45P28004 RPL4BYDR012W 1089 nt13.35□□□□□ -0.27
PRP45P28004 RPL4AYBR031W 1089 nt13.35□□□□□ -0.27
PRP45P28004 PCH2YBR186W 1695 nt13.34□□□□□ -0.27
PRP45P28004 RAD23YEL037C 1197 nt13.34□□□□□ -0.27
PRP45P28004 HHO1YPL127C 777 nt13.34□□□□□ -0.27
PRP45P28004 BDF1YLR399C 2061 nt13.33□□□□□ -0.28
PRP45P28004 ADH7YCR105W 1086 nt13.31□□□□□ -0.28
PRP45P28004 CAB5YDR196C 726 nt13.31□□□□□ -0.28
PRP45P28004 AVT6YER119C 1347 nt13.31□□□□□ -0.28
PRP45P28004 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt13.3□□□□□ -0.28
PRP45P28004 RPS14BYJL191W 417 nt13.3□□□□□ -0.28
PRP45P28004 PAU15YIR041W 375 nt13.29□□□□□ -0.28
PRP45P28004 FUN14YAL008W 597 nt13.29□□□□□ -0.28
PRP45P28004 RAX1YOR301W 1308 nt13.28□□□□□ -0.28
PRP45P28004 CLB6YGR109C 1143 nt13.26□□□□□ -0.29
PRP45P28004 BOP3YNL042W 1191 nt13.26□□□□□ -0.29
PRP45P28004 YCR102CYCR102C 1107 nt13.25□□□□□ -0.29
PRP45P28004 GUT2YIL155C 1950 nt13.25□□□□□ -0.29
PRP45P28004 YLR279WYLR279W 390 nt13.24□□□□□ -0.29
PRP45P28004 RIB3YDR487C 627 nt13.21□□□□□ -0.29
PRP45P28004 GOR1YNL274C 1053 nt13.21□□□□□ -0.29
PRP45P28004 YJL195CYJL195C 702 nt13.2□□□□□ -0.3
PRP45P28004 RTF1YGL244W 1677 nt13.18□□□□□ -0.3
PRP45P28004 YGR012WYGR012W 1182 nt13.17□□□□□ -0.3
PRP45P28004 UTH1YKR042W 1098 nt13.17□□□□□ -0.3
PRP45P28004 TAT1YBR069C 1860 nt13.16□□□□□ -0.3
PRP45P28004 TSC10YBR265W 963 nt13.16□□□□□ -0.3
PRP45P28004 SHH4YLR164W 507 nt13.14□□□□□ -0.31
PRP45P28004 DUT1YBR252W 444 nt13.14□□□□□ -0.31
PRP45P28004 PIB2YGL023C 1908 nt13.13□□□□□ -0.31
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