Protein–RNA interactions for Protein: P16550

APA1, Protein APA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APA1P16550 DDR2YOL052C-A 186 nt10.85□□□□□ -0.67
APA1P16550 YFL067WYFL067W 528 nt10.83□□□□□ -0.68
APA1P16550 ATF2YGR177C 1608 nt10.82□□□□□ -0.68
APA1P16550 STB1YNL309W 1263 nt10.81□□□□□ -0.68
APA1P16550 CRR1YLR213C 1269 nt10.79□□□□□ -0.68
APA1P16550 SPC25YER018C 666 nt10.78□□□□□ -0.68
APA1P16550 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.77□□□□□ -0.69
APA1P16550 PIB2YGL023C 1908 nt10.77□□□□□ -0.69
APA1P16550 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.76□□□□□ -0.69
APA1P16550 GPI16YHR188C 1833 nt10.75□□□□□ -0.69
APA1P16550 CCT4YDL143W 1587 nt10.75□□□□□ -0.69
APA1P16550 YFR018CYFR018C 1092 nt10.74□□□□□ -0.69
APA1P16550 LYS4YDR234W 2082 nt10.72□□□□□ -0.69
APA1P16550 HEM12YDR047W 1089 nt10.72□□□□□ -0.69
APA1P16550 SWC5YBR231C 912 nt10.7□□□□□ -0.7
APA1P16550 FRE6YLL051C 2139 nt10.7□□□□□ -0.7
APA1P16550 BDH1YAL060W 1149 nt10.69□□□□□ -0.7
APA1P16550 YLR415CYLR415C 339 nt10.69□□□□□ -0.7
APA1P16550 SNG1YGR197C 1644 nt10.69□□□□□ -0.7
APA1P16550 VPS60YDR486C 690 nt10.68□□□□□ -0.7
APA1P16550 RRT5YFR032C 870 nt10.68□□□□□ -0.7
APA1P16550 FEN2YCR028C 1539 nt10.68□□□□□ -0.7
APA1P16550 ANP1YEL036C 1503 nt10.68□□□□□ -0.7
APA1P16550 MIC10YCL057C-A 294 nt10.67□□□□□ -0.7
APA1P16550 PTK1YKL198C 1989 nt10.65□□□□□ -0.7
APA1P16550 YSP3YOR003W 1437 nt10.64□□□□□ -0.71
APA1P16550 YFL066CYFL066C 1179 nt10.63□□□□□ -0.71
APA1P16550 PAU16YKL224C 372 nt10.63□□□□□ -0.71
APA1P16550 PRE6YOL038W 765 nt10.63□□□□□ -0.71
APA1P16550 UME6YDR207C 2511 nt10.62□□□□□ -0.71
APA1P16550 PEX25YPL112C 1185 nt10.62□□□□□ -0.71
APA1P16550 ALG3YBL082C 1377 nt10.62□□□□□ -0.71
APA1P16550 YNL115CYNL115C 1935 nt10.6□□□□□ -0.71
APA1P16550 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.59□□□□□ -0.71
APA1P16550 YIR016WYIR016W 798 nt10.59□□□□□ -0.71
APA1P16550 RPM1RPM1 483 nt10.58□□□□□ -0.72
APA1P16550 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.55□□□□□ -0.72
APA1P16550 YFL054CYFL054C 1941 nt10.54□□□□□ -0.72
APA1P16550 BNA2YJR078W 1362 nt10.54□□□□□ -0.72
APA1P16550 RAX1YOR301W 1308 nt10.52□□□□□ -0.73
APA1P16550 SPT8YLR055C 1809 nt10.5□□□□□ -0.73
APA1P16550 VPS75YNL246W 795 nt10.47□□□□□ -0.73
APA1P16550 TIM17YJL143W 477 nt10.45□□□□□ -0.74
APA1P16550 MIC12YBR262C 321 nt10.45□□□□□ -0.74
APA1P16550 YJL225CYJL225C 5277 nt10.44□□□□□ -0.74
APA1P16550 GLK1YCL040W 1503 nt10.42□□□□□ -0.74
APA1P16550 NAT4YMR069W 858 nt10.41□□□□□ -0.74
APA1P16550 HHO1YPL127C 777 nt10.41□□□□□ -0.74
APA1P16550 XDJ1YLR090W 1380 nt10.4□□□□□ -0.74
APA1P16550 SHM2YLR058C 1410 nt10.39□□□□□ -0.75
APA1P16550 PAU7YAR020C 168 nt10.37□□□□□ -0.75
APA1P16550 GDH3YAL062W 1374 nt10.37□□□□□ -0.75
APA1P16550 YGR201CYGR201C 678 nt10.35□□□□□ -0.75
APA1P16550 MIR1YJR077C 936 nt10.34□□□□□ -0.75
APA1P16550 THI74YDR438W 1113 nt10.33□□□□□ -0.76
APA1P16550 MSF1YPR047W 1410 nt10.31□□□□□ -0.76
APA1P16550 SWE1YJL187C 2460 nt10.28□□□□□ -0.76
APA1P16550 AVT6YER119C 1347 nt10.28□□□□□ -0.76
APA1P16550 CCA1YER168C 1641 nt10.27□□□□□ -0.77
APA1P16550 NIT1YIL164C 600 nt10.27□□□□□ -0.77
APA1P16550 SGT2YOR007C 1041 nt10.27□□□□□ -0.77
APA1P16550 GOR1YNL274C 1053 nt10.26□□□□□ -0.77
APA1P16550 BOR1YNL275W 1731 nt10.23□□□□□ -0.77
APA1P16550 SHB17YKR043C 816 nt10.22□□□□□ -0.77
APA1P16550 DAT1YML113W 747 nt10.22□□□□□ -0.77
APA1P16550 SBA1YKL117W 651 nt10.21□□□□□ -0.77
APA1P16550 UBA4YHR111W 1323 nt10.21□□□□□ -0.78
APA1P16550 AGP1YCL025C 1902 nt10.19□□□□□ -0.78
APA1P16550 YDR010CYDR010C 333 nt10.16□□□□□ -0.78
APA1P16550 YSR3YKR053C 1215 nt10.16□□□□□ -0.78
APA1P16550 DUT1YBR252W 444 nt10.16□□□□□ -0.78
APA1P16550 MCH5YOR306C 1566 nt10.16□□□□□ -0.78
APA1P16550 YCR102CYCR102C 1107 nt10.14□□□□□ -0.79
APA1P16550 YGL034CYGL034C 366 nt10.14□□□□□ -0.79
APA1P16550 DUS1YML080W 1272 nt10.13□□□□□ -0.79
APA1P16550 PHO89YBR296C 1725 nt10.1□□□□□ -0.79
APA1P16550 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.1□□□□□ -0.79
APA1P16550 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.1□□□□□ -0.79
APA1P16550 RET2YFR051C 1641 nt10.09□□□□□ -0.79
APA1P16550 XYL2YLR070C 1071 nt10.08□□□□□ -0.8
APA1P16550 YCR087WYCR087W 516 nt10.06□□□□□ -0.8
APA1P16550 STR3YGL184C 1398 nt10.02□□□□□ -0.8
APA1P16550 YCL074WYCL074W 927 nt10.02□□□□□ -0.81
APA1P16550 RBG1YAL036C 1110 nt10.02□□□□□ -0.81
APA1P16550 AQY2YLL052C 450 nt10.02□□□□□ -0.81
APA1P16550 MRP20YDR405W 792 nt10.01□□□□□ -0.81
APA1P16550 NDI1YML120C 1542 nt10.01□□□□□ -0.81
APA1P16550 NBP35YGL091C 987 nt10□□□□□ -0.81
APA1P16550 AIM45YPR004C 1035 nt9.98□□□□□ -0.81
APA1P16550 GLR1YPL091W 1452 nt9.98□□□□□ -0.81
APA1P16550 SFA1YDL168W 1161 nt9.97□□□□□ -0.81
APA1P16550 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.96□□□□□ -0.82
APA1P16550 COQ2YNR041C 1119 nt9.96□□□□□ -0.82
APA1P16550 FUR4YBR021W 1902 nt9.95□□□□□ -0.82
APA1P16550 TIR3YIL011W 810 nt9.95□□□□□ -0.82
APA1P16550 YMR244WYMR244W 1068 nt9.95□□□□□ -0.82
APA1P16550 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.95□□□□□ -0.82
APA1P16550 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.95□□□□□ -0.82
APA1P16550 BSP1YPR171W 1731 nt9.92□□□□□ -0.82
APA1P16550 SHH4YLR164W 507 nt9.9□□□□□ -0.82
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