Protein–RNA interactions for Protein: P0CF16

YML003W, UPF0507 protein YML003W, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML003WP0CF16 BIO4YNR057C 714 nt9.42□□□□□ -0.9
YML003WP0CF16 FUR4YBR021W 1902 nt9.42□□□□□ -0.9
YML003WP0CF16 YLR179CYLR179C 606 nt9.4□□□□□ -0.9
YML003WP0CF16 YLL053CYLL053C 459 nt9.38□□□□□ -0.91
YML003WP0CF16 AQY1YPR192W 918 nt9.38□□□□□ -0.91
YML003WP0CF16 YPR064WYPR064W 420 nt9.36□□□□□ -0.91
YML003WP0CF16 NAR1YNL240C 1476 nt9.34□□□□□ -0.91
YML003WP0CF16 FTR1YER145C 1215 nt9.34□□□□□ -0.91
YML003WP0CF16 ERF2YLR246W 1080 nt9.34□□□□□ -0.91
YML003WP0CF16 AAC1YMR056C 930 nt9.34□□□□□ -0.91
YML003WP0CF16 PRP4YPR178W 1398 nt9.34□□□□□ -0.91
YML003WP0CF16 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.32□□□□□ -0.92
YML003WP0CF16 GAL1YBR020W 1587 nt9.29□□□□□ -0.92
YML003WP0CF16 YFL067WYFL067W 528 nt9.29□□□□□ -0.92
YML003WP0CF16 DPS1YLL018C 1674 nt9.29□□□□□ -0.92
YML003WP0CF16 AHT1YHR093W 549 nt9.28□□□□□ -0.92
YML003WP0CF16 TAD3YLR316C 969 nt9.27□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 YDR094WYDR094W 336 nt9.26□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.26□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 CRR1YLR213C 1269 nt9.26□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 DDR2YOL052C-A 186 nt9.26□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 TRM5YHR070W 1500 nt9.26□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 WSC2YNL283C 1512 nt9.26□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 CCA1YER168C 1641 nt9.23□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 BMT6YLR063W 1098 nt9.23□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 STB1YNL309W 1263 nt9.22□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 ATF2YGR177C 1608 nt9.22□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 GPI16YHR188C 1833 nt9.21□□□□□ -0.93
YML003WP0CF16 SPC25YER018C 666 nt9.21□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 UBX6YJL048C 1191 nt9.2□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.19□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 RAX1YOR301W 1308 nt9.19□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 BIO5YNR056C 1686 nt9.19□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.18□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 HEM12YDR047W 1089 nt9.18□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 PBP1YGR178C 2169 nt9.16□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 CCT4YDL143W 1587 nt9.16□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 CYT2YKL087C 675 nt9.15□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 SWC5YBR231C 912 nt9.15□□□□□ -0.94
YML003WP0CF16 YKR005CYKR005C 1578 nt9.15□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 SNF1YDR477W 1902 nt9.14□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 YFR018CYFR018C 1092 nt9.13□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 YLR415CYLR415C 339 nt9.13□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 MIC10YCL057C-A 294 nt9.13□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 ANP1YEL036C 1503 nt9.13□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 SNG1YGR197C 1644 nt9.13□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 FEN2YCR028C 1539 nt9.1□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 VPS60YDR486C 690 nt9.1□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 RRT5YFR032C 870 nt9.09□□□□□ -0.95
YML003WP0CF16 BDH1YAL060W 1149 nt9.08□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 PEX25YPL112C 1185 nt9.07□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 CMP2YML057W 1815 nt9.07□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 FRE6YLL051C 2139 nt9.07□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 NME1NME1 340 nt9.06□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 BNA2YJR078W 1362 nt9.05□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 IRC24YIR036C 792 nt9.05□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 YSP3YOR003W 1437 nt9.04□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 YGR259CYGR259C 441 nt9.03□□□□□ -0.96
YML003WP0CF16 ALG3YBL082C 1377 nt9.02□□□□□ -0.97
YML003WP0CF16 RPM1RPM1 483 nt9.02□□□□□ -0.97
YML003WP0CF16 YCL074WYCL074W 927 nt9.01□□□□□ -0.97
YML003WP0CF16 YIR016WYIR016W 798 nt9.01□□□□□ -0.97
YML003WP0CF16 PAU16YKL224C 372 nt9□□□□□ -0.97
YML003WP0CF16 YNL115CYNL115C 1935 nt8.99□□□□□ -0.97
YML003WP0CF16 DUS1YML080W 1272 nt8.98□□□□□ -0.97
YML003WP0CF16 VPS75YNL246W 795 nt8.96□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 PRE6YOL038W 765 nt8.96□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 YFL066CYFL066C 1179 nt8.95□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 TIM17YJL143W 477 nt8.95□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 MIC12YBR262C 321 nt8.95□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 AGP1YCL025C 1902 nt8.94□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 HSL7YBR133C 2484 nt8.93□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.92□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 YGR201CYGR201C 678 nt8.91□□□□□ -0.98
YML003WP0CF16 XDJ1YLR090W 1380 nt8.89□□□□□ -0.99
YML003WP0CF16 NDI1YML120C 1542 nt8.89□□□□□ -0.99
YML003WP0CF16 YAT1YAR035W 2064 nt8.89□□□□□ -0.99
YML003WP0CF16 HHO1YPL127C 777 nt8.88□□□□□ -0.99
YML003WP0CF16 PAU7YAR020C 168 nt8.86□□□□□ -0.99
YML003WP0CF16 NAT4YMR069W 858 nt8.86□□□□□ -0.99
YML003WP0CF16 SHM2YLR058C 1410 nt8.85□□□□□ -0.99
YML003WP0CF16 GDH3YAL062W 1374 nt8.83□□□□□ -1
YML003WP0CF16 MIR1YJR077C 936 nt8.79□□□□□ -1
YML003WP0CF16 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.79□□□□□ -1
YML003WP0CF16 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.79□□□□□ -1
YML003WP0CF16 THI74YDR438W 1113 nt8.78□□□□□ -1
YML003WP0CF16 AVT6YER119C 1347 nt8.78□□□□□ -1
YML003WP0CF16 GOR1YNL274C 1053 nt8.77□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 STR3YGL184C 1398 nt8.76□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 SPT20YOL148C 1815 nt8.76□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 MSF1YPR047W 1410 nt8.76□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 SGT2YOR007C 1041 nt8.75□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.75□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.75□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 NIT1YIL164C 600 nt8.74□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 DAT1YML113W 747 nt8.73□□□□□ -1.01
YML003WP0CF16 SHB17YKR043C 816 nt8.7□□□□□ -1.02
YML003WP0CF16 RTN2YDL204W 1182 nt8.69□□□□□ -1.02
YML003WP0CF16 HEL2YDR266C 1920 nt8.68□□□□□ -1.02
YML003WP0CF16 UBA4YHR111W 1323 nt8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms