Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VPREB3Q9UKI3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms