Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFHD1Q9BUP0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFHD1Q9BUP0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms