Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC38A9Q8NBW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC38A9Q8NBW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms