Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HSPB3Q12988 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSPB3Q12988 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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