Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCE1P61221 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCE1P61221 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms