Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFIT3O14879 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFIT3O14879 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFIT3O14879 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms