Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0B3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0B3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A087X0B3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms