Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX25Q9UHL0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms