Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NECAP2Q9NVZ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NECAP2Q9NVZ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NECAP2Q9NVZ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NECAP2Q9NVZ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NECAP2Q9NVZ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NECAP2Q9NVZ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NECAP2Q9NVZ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms