Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERGIC2Q96RQ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERGIC2Q96RQ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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