Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGD4Q96M96 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGD4Q96M96 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms