Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCUBE3Q8IX30 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCUBE3Q8IX30 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCUBE3Q8IX30 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms