Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPTNQ6XPR3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms