Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EFCAB12Q6NXP0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFCAB12Q6NXP0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms