Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YIM2YMR151W 438 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YNR062CYNR062C 984 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 PSH1YOL054W 1221 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 PFK27YOL136C 1194 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 CWC27YPL064C 906 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 ATG14YBR128C 1035 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YBR144CYBR144C 315 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 STB3YDR169C 1542 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 TKL1YPR074C 2043 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 VNX1YNL321W 2727 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YEH1YLL012W 1722 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YME1YPR024W 2244 nt6.06□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF3Q07807 VHT1YGR065C 1782 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 CUS1YMR240C 1311 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 TAF8YML114C 1533 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 LTO1YNL260C 597 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 RDL1YOR285W 420 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 RDL2YOR286W 450 nt6.06□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF3Q07807 TEL2YGR099W 2067 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SEC12YNR026C 1416 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 ATP1YBL099W 1638 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YFL042CYFL042C 2025 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 ECM7YLR443W 1347 nt6.05□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF3Q07807 MNS1YJR131W 1650 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SIT4YDL047W 936 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YDL057WYDL057W 987 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 OCA6YDR067C 675 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YER010CYER010C 705 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YKR070WYKR070W 1059 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 ELA1YNL230C 1140 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YOL131WYOL131W 327 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 PNG1YPL096W 1092 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YPL199CYPL199C 723 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 MID1YNL291C 1647 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 CIK1YMR198W 1785 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 GUA1YMR217W 1578 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SEC18YBR080C 2277 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 AMD1YML035C 2433 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 IDP1YDL066W 1287 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 UGX2YDL169C 672 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SLU7YDR088C 1149 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YDR290WYDR290W 330 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 RTR1YER139C 681 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YGL262WYGL262W 528 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 VMA7YGR020C 357 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SYF2YGR129W 648 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 HSP150YJL159W 1242 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 TTI2YJR136C 1266 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 TIS11YLR136C 858 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 ECM19YLR390W 339 nt6.04□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF3Q07807 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 RPS10BYMR230W 318 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 AAD15YOL165C 432 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 GLO4YOR040W 858 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YOR338WYOR338W 1092 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 CLB1YGR108W 1416 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SKN1YGR143W 2316 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SRP101YDR292C 1866 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 HXT7YDR342C 1713 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 HXT6YDR343C 1713 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 KTR5YNL029C 1569 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 WTM2YOR229W 1404 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 IWR1YDL115C 1062 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SEC20YDR498C 1152 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 CHO1YER026C 831 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 DDI2YFL061W 678 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 VMA16YHR026W 642 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 ATG38YLR211C 681 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 DDI3YNL335W 678 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 ETT1YOR051C 1239 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 YML082WYML082W 1950 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 SIT1YEL065W 1887 nt6.02□□□□□ -1.44
PUF3Q07807 LYS21YDL131W 1323 nt6.02□□□□□ -1.45 RIP-Chip
PUF3Q07807 MTH1YDR277C 1302 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 PYC1YGL062W 3537 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 SET4YJL105W 1683 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 SAC6YDR129C 1929 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 KEX2YNL238W 2445 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YGR115CYGR115C 780 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 MRT4YKL009W 711 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YLR042CYLR042C 486 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YLR326WYLR326W 723 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YOR238WYOR238W 912 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YBR124WYBR124W 360 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 ATG12YBR217W 561 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YIL001WYIL001W 1542 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 GPT2YKR067W 2232 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 COQ6YGR255C 1440 nt6.01□□□□□ -1.45 RIP-Chip
PUF3Q07807 MTC1YJL123C 1437 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 RAD55YDR076W 1221 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 INO2YDR123C 915 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 FCF1YDR339C 570 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 SNZ3YFL059W 897 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 CWC23YGL128C 852 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF3Q07807 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt6.01□□□□□ -1.45
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