Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCT4P50991 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCT4P50991 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCT4P50991 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCT4P50991 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCT4P50991 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCT4P50991 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCT4P50991 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCT4P50991 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCT4P50991 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT4P50991 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT4P50991 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT4P50991 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT4P50991 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCT4P50991 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCT4P50991 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCT4P50991 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCT4P50991 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCT4P50991 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCT4P50991 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT4P50991 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT4P50991 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT4P50991 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCT4P50991 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCT4P50991 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCT4P50991 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCT4P50991 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCT4P50991 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCT4P50991 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCT4P50991 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCT4P50991 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCT4P50991 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCT4P50991 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT4P50991 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT4P50991 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT4P50991 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT4P50991 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT4P50991 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT4P50991 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCT4P50991 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCT4P50991 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCT4P50991 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms