Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB5P28074 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB5P28074 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms