Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF44P15621 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF44P15621 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms