Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0S8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0S8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0S8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0S8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0S8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0S8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0S8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0S8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0S8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0S8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0S8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0S8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0S8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C0S8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C0S8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0S8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0S8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0S8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0S8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0S8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms