Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FARSAQ9Y285 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FARSAQ9Y285 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms