Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPSEQ9Y251 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPSEQ9Y251 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPSEQ9Y251 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HPSEQ9Y251 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms