Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX15Q9NRS6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms