Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRA6Q9BX79 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRA6Q9BX79 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRA6Q9BX79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms