Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF649Q9BS31 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms