Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HHIPQ96QV1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HHIPQ96QV1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms