Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP9Q8IXQ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP9Q8IXQ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP9Q8IXQ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms